More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3743 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 322 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  77.02 
 
 		 322 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  77.95 
 
 		 322 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  77.64 
 
 		 322 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  77.5 
 
 		 322 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  71.12 
 
 		 322 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  68.75 
 
 		 322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  52.5 
 
 		 322 aa  344  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  48.75 
 
 		 360 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  48.9 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  48.09 
 
 		 322 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 341 aa  291  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  49.84 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  47.48 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  46.52 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  47.13 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  47.13 
 
 		 322 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  47.13 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  46.89 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  47 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  45.54 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  46.54 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  46.25 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  46.5 
 
 		 322 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  47.13 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  45.86 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  45.54 
 
 		 323 aa  279  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  46.25 
 
 		 343 aa  279  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  45.54 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  45.54 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  45.54 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  45.54 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  45.54 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  45.54 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  45.54 
 
 		 323 aa  279  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  45.57 
 
 		 323 aa  278  7e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  46.51 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  46.98 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  46.51 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  45.48 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  45.86 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 		 370 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 		 370 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 		 370 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 		 370 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 		 370 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  43.67 
 
 		 341 aa  275  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  44.48 
 
 		 323 aa  275  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  48.09 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  42.5 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  42.99 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  43.31 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  43.35 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  42.06 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  41.56 
 
 		 337 aa  271  9e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  47.92 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  41.56 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  42.68 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  44.38 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  44.51 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 		 323 aa  269  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  44.14 
 
 		 323 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  45.03 
 
 		 323 aa  268  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  42.81 
 
 		 327 aa  268  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  49.33 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  47.84 
 
 		 322 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  45.57 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  44.38 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  43.17 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  43.52 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  44.3 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  47.12 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  43.57 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  44.76 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  42.59 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  49.03 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  43.93 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  46.44 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  43.44 
 
 		 323 aa  262  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  49.03 
 
 		 323 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  49.03 
 
 		 323 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  45.05 
 
 		 323 aa  261  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  49.03 
 
 		 323 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  47.63 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  43.62 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  45.37 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  45.37 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  44.69 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  45.37 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  42.95 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  41.72 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  44.73 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  42.68 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  45.37 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  40.63 
 
 		 351 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  40.94 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  47.32 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  43.88 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>