More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3733 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 256 aa  527  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  89.74 
 
 		 255 aa  447  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  90.17 
 
 		 255 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  86.75 
 
 		 251 aa  427  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  85.04 
 
 		 251 aa  428  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  80.54 
 
 		 257 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  79.3 
 
 		 257 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  70 
 
 		 267 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1778  ribosomal protein S2  66.27 
 
 		 274 aa  349  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  71.24 
 
 		 233 aa  347  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  66.81 
 
 		 244 aa  345  5e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  68.58 
 
 		 248 aa  344  8e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  65.45 
 
 		 304 aa  342  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  67.26 
 
 		 301 aa  341  5.999999999999999e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  67.39 
 
 		 232 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  71.04 
 
 		 315 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  71.04 
 
 		 343 aa  335  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  71.04 
 
 		 314 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  66.38 
 
 		 238 aa  333  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  66.81 
 
 		 235 aa  332  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  70.78 
 
 		 301 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  62.4 
 
 		 252 aa  329  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  65.93 
 
 		 235 aa  328  6e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  65.04 
 
 		 232 aa  327  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  62.6 
 
 		 235 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  62.15 
 
 		 252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  63.04 
 
 		 236 aa  325  4.0000000000000003e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  58.66 
 
 		 262 aa  323  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  64.6 
 
 		 244 aa  322  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  66.96 
 
 		 243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  60.42 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  64.29 
 
 		 257 aa  318  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  59.49 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  59.49 
 
 		 254 aa  316  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  60.32 
 
 		 281 aa  315  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  65.18 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  59.52 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  63.72 
 
 		 233 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  63.72 
 
 		 233 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  61.04 
 
 		 233 aa  311  9e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  61.04 
 
 		 233 aa  311  9e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  63.27 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  63.27 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  63.27 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  63.27 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  63.27 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  63.27 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  63.27 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  62.01 
 
 		 289 aa  310  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  63.27 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  58.2 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  58.59 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  62.83 
 
 		 233 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  59.61 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  62.78 
 
 		 291 aa  309  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  59.44 
 
 		 280 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  58.2 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  62.5 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  60.7 
 
 		 255 aa  305  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  62.88 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  60.62 
 
 		 255 aa  305  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  60.62 
 
 		 255 aa  305  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  61.06 
 
 		 262 aa  304  8.000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  59.65 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  60.27 
 
 		 260 aa  300  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  59.65 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  60.27 
 
 		 262 aa  300  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  61.06 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0346  30S ribosomal protein S2  61.16 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.564303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1161  30S ribosomal protein S2  56.86 
 
 		 300 aa  299  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3581  30S ribosomal protein S2  57.65 
 
 		 289 aa  299  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1442  30S ribosomal protein S2  56.86 
 
 		 258 aa  297  9e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.333535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  59.21 
 
 		 288 aa  297  9e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1276  30S ribosomal protein S2  56.84 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000462027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1668  ribosomal protein S2  60.96 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12904  30S ribosomal protein S2  60.53 
 
 		 287 aa  297  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0383521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1466  30S ribosomal protein S2  59.03 
 
 		 247 aa  295  3e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.162448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2104  ribosomal protein S2  58 
 
 		 272 aa  295  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  56.5 
 
 		 243 aa  295  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1266  30S ribosomal protein S2  59.47 
 
 		 267 aa  295  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0551  30S ribosomal protein S2  60.18 
 
 		 262 aa  294  7e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000123187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0808  ribosomal protein S2  61.16 
 
 		 269 aa  294  8e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0577  30S ribosomal protein S2  57.14 
 
 		 294 aa  294  8e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000845501  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1262  30S ribosomal protein S2  54.55 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000765471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  60.18 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1974  30S ribosomal protein S2  59.21 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1993  30S ribosomal protein S2  59.21 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2039  30S ribosomal protein S2  59.21 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.07144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  57.25 
 
 		 255 aa  292  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1454  ribosomal protein S2  56.67 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118632  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  60 
 
 		 238 aa  291  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  60.44 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  59.29 
 
 		 303 aa  291  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4133  30S ribosomal protein S2  54.4 
 
 		 279 aa  290  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0676  30S ribosomal protein S2  59.03 
 
 		 292 aa  290  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.560219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0237  ribosomal protein S2  58.59 
 
 		 314 aa  290  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.245227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0406  ribosomal protein S2  59.29 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  55.73 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3991  ribosomal protein S2  58.08 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2209  30S ribosomal protein S2  58.85 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.092398  normal  0.16392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>