More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3730 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  80.54 
 
 		 185 aa  317  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  78.38 
 
 		 185 aa  308  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  79.46 
 
 		 185 aa  302  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  77.84 
 
 		 185 aa  298  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  72.97 
 
 		 185 aa  281  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  67.57 
 
 		 185 aa  263  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  62.64 
 
 		 184 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  60.34 
 
 		 186 aa  223  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  58.05 
 
 		 186 aa  217  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  55.75 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  53.59 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 184 aa  204  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 186 aa  197  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  53.3 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  53.85 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 192 aa  195  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 184 aa  194  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  194  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  53.18 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  54.02 
 
 		 174 aa  192  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 187 aa  191  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  50 
 
 		 191 aa  191  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 182 aa  190  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 188 aa  190  9e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 173 aa  189  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0281  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 181 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  48.63 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  47.43 
 
 		 187 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  46.45 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0811  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  50.82 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  47.13 
 
 		 182 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  184  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0575  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 187 aa  184  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>