102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3723 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 2286 aa  4567    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  35.87 
 
 		 4433 aa  618  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  31.65 
 
 		 2068 aa  572  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  29.28 
 
 		 3507 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 3333 aa  115  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  27.92 
 
 		 400 aa  103  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  32.06 
 
 		 436 aa  100  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  28.08 
 
 		 403 aa  95.9  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  30.74 
 
 		 480 aa  91.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  30.81 
 
 		 463 aa  90.1  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  29.81 
 
 		 471 aa  89  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  29.63 
 
 		 439 aa  87.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  26.65 
 
 		 1042 aa  86.7  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  24.61 
 
 		 779 aa  85.9  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  26.24 
 
 		 401 aa  85.1  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  30.33 
 
 		 456 aa  84  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  26.75 
 
 		 501 aa  83.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  26.46 
 
 		 485 aa  81.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  27.91 
 
 		 491 aa  80.5  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  25.35 
 
 		 9585 aa  77.4  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  25.16 
 
 		 378 aa  77.4  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  29.41 
 
 		 513 aa  74.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  49.38 
 
 		 409 aa  74.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.8 
 
 		 795 aa  72.8  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  29.15 
 
 		 450 aa  71.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  27.57 
 
 		 391 aa  71.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  32.79 
 
 		 472 aa  70.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  30.61 
 
 		 656 aa  69.3  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  33.16 
 
 		 1160 aa  65.9  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  29.51 
 
 		 683 aa  65.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  28.01 
 
 		 1363 aa  64.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  26.91 
 
 		 480 aa  63.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  26.35 
 
 		 771 aa  63.5  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  39.25 
 
 		 340 aa  63.2  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  27.25 
 
 		 2554 aa  62.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.74 
 
 		 649 aa  62.4  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 2170 aa  62  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  30.63 
 
 		 782 aa  62.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 995 aa  59.7  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  29.6 
 
 		 836 aa  59.7  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  28.71 
 
 		 692 aa  59.3  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  29.49 
 
 		 404 aa  58.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  24.4 
 
 		 903 aa  58.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  25.24 
 
 		 1973 aa  58.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.04 
 
 		 1848 aa  58.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  29.06 
 
 		 688 aa  58.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  33.9 
 
 		 527 aa  58.2  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  27.38 
 
 		 408 aa  57  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  26.4 
 
 		 701 aa  56.2  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  28.9 
 
 		 1735 aa  55.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  31.68 
 
 		 3295 aa  55.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  27.7 
 
 		 1067 aa  55.5  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  26.6 
 
 		 1363 aa  54.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5269  Fibronectin type III domain protein  30.09 
 
 		 1633 aa  54.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  28.19 
 
 		 708 aa  53.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  25.66 
 
 		 940 aa  53.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  36.44 
 
 		 761 aa  53.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  29.03 
 
 		 3802 aa  52.4  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  26.39 
 
 		 1380 aa  52  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  22.74 
 
 		 626 aa  52.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  30.35 
 
 		 917 aa  52  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  27.8 
 
 		 741 aa  52  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  37.8 
 
 		 696 aa  52.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  29.41 
 
 		 1065 aa  52  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1933 aa  51.6  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  29.71 
 
 		 918 aa  51.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.73 
 
 		 1272 aa  51.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  24.65 
 
 		 680 aa  51.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  24.56 
 
 		 1172 aa  51.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  30.11 
 
 		 1063 aa  51.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  24.16 
 
 		 404 aa  51.6  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  23.9 
 
 		 528 aa  50.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  27.23 
 
 		 999 aa  50.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  32.95 
 
 		 553 aa  50.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  26.24 
 
 		 841 aa  50.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  24.2 
 
 		 430 aa  50.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  36.96 
 
 		 1916 aa  50.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  40.28 
 
 		 1557 aa  50.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  23.9 
 
 		 1131 aa  49.7  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  31.25 
 
 		 211 aa  49.7  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.81 
 
 		 3027 aa  49.7  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  38.2 
 
 		 1115 aa  49.3  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2757  fibronectin, type III  34.88 
 
 		 490 aa  48.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.48041  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  30.53 
 
 		 670 aa  48.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  31.61 
 
 		 717 aa  48.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1062 aa  48.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  25.37 
 
 		 870 aa  48.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  27.37 
 
 		 831 aa  47.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  30.22 
 
 		 938 aa  47.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  25.38 
 
 		 889 aa  47.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  35.88 
 
 		 743 aa  47  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  30.43 
 
 		 1199 aa  47  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  25.45 
 
 		 667 aa  46.6  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  33.09 
 
 		 14944 aa  46.6  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  28.29 
 
 		 455 aa  46.2  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  28.29 
 
 		 455 aa  46.2  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1969 aa  46.2  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  29.45 
 
 		 456 aa  46.2  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  25.29 
 
 		 382 aa  45.8  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  29.82 
 
 		 825 aa  45.8  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>