More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3701 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0896  tldD protein  73.48 
 
 		 460 aa  685    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  70.15 
 
 		 460 aa  653    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  80.43 
 
 		 460 aa  736    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 460 aa  920    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  69.93 
 
 		 460 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.66 
 
 		 476 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  53.06 
 
 		 467 aa  471  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.93 
 
 		 483 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.67 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.53 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.18 
 
 		 497 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.22 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.68 
 
 		 475 aa  425  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.71 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.67 
 
 		 462 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.72 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  43.79 
 
 		 475 aa  345  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.27 
 
 		 462 aa  343  4e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.27 
 
 		 462 aa  343  5e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  43.11 
 
 		 483 aa  342  9e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  41.77 
 
 		 480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  39.91 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  39.7 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  41.77 
 
 		 480 aa  338  8e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  42.89 
 
 		 481 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.35 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  42.83 
 
 		 481 aa  332  9e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.16 
 
 		 486 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.83 
 
 		 459 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.78 
 
 		 481 aa  329  7e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.7 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.19 
 
 		 480 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  40.92 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  41.78 
 
 		 479 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.78 
 
 		 479 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.09 
 
 		 479 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  41.7 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.78 
 
 		 479 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  40.86 
 
 		 485 aa  325  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  42.03 
 
 		 481 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.86 
 
 		 485 aa  323  4e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  41.7 
 
 		 480 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.92 
 
 		 462 aa  322  7e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.73 
 
 		 481 aa  322  8e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  42.73 
 
 		 481 aa  322  8e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  39.15 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  42.05 
 
 		 481 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  38.68 
 
 		 486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.67 
 
 		 496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  42.61 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  41.3 
 
 		 480 aa  319  6e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  40.52 
 
 		 486 aa  319  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.73 
 
 		 493 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.94 
 
 		 480 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.53 
 
 		 459 aa  318  9e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.46 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.46 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.17 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  40.85 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.41 
 
 		 480 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  40.62 
 
 		 481 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.56 
 
 		 482 aa  318  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.68 
 
 		 481 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  40.62 
 
 		 481 aa  318  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.95 
 
 		 486 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  40.62 
 
 		 481 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  41.61 
 
 		 493 aa  317  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.73 
 
 		 486 aa  316  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.42 
 
 		 508 aa  316  5e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  41.28 
 
 		 477 aa  316  6e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  43.04 
 
 		 481 aa  316  7e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.13 
 
 		 477 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.03 
 
 		 490 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  41.1 
 
 		 477 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  40.38 
 
 		 490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.98 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.52 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  39.23 
 
 		 481 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  41.18 
 
 		 491 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.96 
 
 		 489 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  42.07 
 
 		 480 aa  313  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.22 
 
 		 462 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  42.89 
 
 		 488 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  40.17 
 
 		 481 aa  312  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.67 
 
 		 482 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42 
 
 		 490 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  41.59 
 
 		 481 aa  312  9e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.47 
 
 		 488 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  41.2 
 
 		 497 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  41.63 
 
 		 486 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.24 
 
 		 479 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1296  tldD protein  42.51 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.576694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.34 
 
 		 487 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.95 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  40.95 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  41.63 
 
 		 498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  40.95 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  40.95 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  40.95 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  40.95 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>