More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3693 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  100 
 
 
404 aa  839    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  68.91 
 
 
403 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  66.92 
 
 
404 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  66.33 
 
 
439 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  65.67 
 
 
412 aa  554  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  62.41 
 
 
410 aa  548  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  57.32 
 
 
413 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  55.17 
 
 
406 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  51.6 
 
 
406 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  50.74 
 
 
411 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  52.36 
 
 
406 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  50.12 
 
 
405 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  50.38 
 
 
419 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  49.14 
 
 
407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  50.81 
 
 
408 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  47.94 
 
 
409 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  47.68 
 
 
409 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  48.26 
 
 
404 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  46.27 
 
 
420 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  47.56 
 
 
435 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  45.83 
 
 
426 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  48.26 
 
 
430 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  47.42 
 
 
411 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  43.25 
 
 
427 aa  368  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  44.53 
 
 
412 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  44.58 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  43.56 
 
 
422 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  43.32 
 
 
422 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  41.79 
 
 
426 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  41.79 
 
 
426 aa  346  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  41.79 
 
 
426 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  41.79 
 
 
426 aa  346  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  41.79 
 
 
426 aa  346  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  41.79 
 
 
426 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  41.79 
 
 
426 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  41.79 
 
 
426 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  41.54 
 
 
426 aa  345  8e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  41.54 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  42.12 
 
 
422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  42.12 
 
 
422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  40.86 
 
 
426 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  40.89 
 
 
422 aa  333  4e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  43.17 
 
 
411 aa  332  8e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  48.2 
 
 
442 aa  323  4e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  43.45 
 
 
411 aa  312  5.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  40.15 
 
 
428 aa  305  7e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  38.67 
 
 
430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  45.73 
 
 
418 aa  298  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  38.56 
 
 
428 aa  297  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  47.46 
 
 
548 aa  293  3e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  42.16 
 
 
471 aa  291  1e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  39.14 
 
 
453 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  39.14 
 
 
454 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  39.14 
 
 
454 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  39.14 
 
 
454 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  39.05 
 
 
455 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  43.95 
 
 
423 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  38.9 
 
 
454 aa  289  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  43.05 
 
 
414 aa  286  4e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  38.36 
 
 
462 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  40.57 
 
 
440 aa  286  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  38.42 
 
 
454 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  41.94 
 
 
438 aa  285  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  37.99 
 
 
458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  37.99 
 
 
458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  38.33 
 
 
455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  37.79 
 
 
461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  39.27 
 
 
471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  38.39 
 
 
455 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  39.38 
 
 
453 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  38.46 
 
 
455 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  38.46 
 
 
455 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  38.23 
 
 
453 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  38.79 
 
 
455 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  37.86 
 
 
447 aa  281  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  38.54 
 
 
455 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  38.33 
 
 
462 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  37.91 
 
 
465 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  38.23 
 
 
453 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  40.46 
 
 
453 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  39.9 
 
 
464 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  36.87 
 
 
469 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  40.57 
 
 
433 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  39.66 
 
 
464 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  38.44 
 
 
467 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  36.92 
 
 
450 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  37.47 
 
 
463 aa  276  7e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  39.08 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1849  peptidase U32  40.91 
 
 
478 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  39.19 
 
 
440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  38.04 
 
 
453 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  36.71 
 
 
464 aa  269  7e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  36.71 
 
 
464 aa  269  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  39.69 
 
 
444 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0716  peptidase U32  40.35 
 
 
408 aa  269  8e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0755954  normal  0.409296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  36.71 
 
 
464 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  39.11 
 
 
452 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  36.91 
 
 
494 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  40.61 
 
 
810 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  36.67 
 
 
458 aa  266  5.999999999999999e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>