More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3690 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 359 aa  723    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  68.68 
 
 		 359 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  67.31 
 
 		 359 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  67.79 
 
 		 358 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  64.87 
 
 		 356 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  62.12 
 
 		 371 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  55.31 
 
 		 364 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  49.59 
 
 		 386 aa  323  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  46.54 
 
 		 370 aa  310  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  45.65 
 
 		 389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  46.31 
 
 		 362 aa  299  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  43.6 
 
 		 374 aa  289  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  41.76 
 
 		 409 aa  276  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  44.63 
 
 		 361 aa  276  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  45.35 
 
 		 366 aa  275  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  43.7 
 
 		 366 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  44.02 
 
 		 385 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  44.35 
 
 		 365 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  44.21 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 373 aa  269  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  42.27 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  45.3 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.1 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  40.35 
 
 		 356 aa  265  5.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  42.27 
 
 		 406 aa  265  8e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  44.89 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  44.78 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  43.53 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  43.13 
 
 		 394 aa  256  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  44.02 
 
 		 336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  42.21 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  40.72 
 
 		 389 aa  252  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  43.23 
 
 		 360 aa  252  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  40.49 
 
 		 372 aa  249  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  39.17 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  38.57 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  42.73 
 
 		 375 aa  245  8e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  46.52 
 
 		 358 aa  245  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  40.88 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  40.72 
 
 		 379 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  40.88 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  44.25 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  41.6 
 
 		 399 aa  242  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  41.49 
 
 		 374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  39.46 
 
 		 365 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  48.56 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  38.57 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  38.71 
 
 		 425 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  39.61 
 
 		 382 aa  235  7e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  38.5 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  42.61 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  41.1 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  40.81 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  40.5 
 
 		 369 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  44.63 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  38.75 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.03 
 
 		 365 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  39.57 
 
 		 401 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  38.11 
 
 		 370 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  42.34 
 
 		 364 aa  228  9e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  40.22 
 
 		 369 aa  228  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  34.71 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  40.21 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  37.07 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  45.59 
 
 		 361 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  43.53 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  41.03 
 
 		 366 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  42.17 
 
 		 375 aa  226  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  42.74 
 
 		 365 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  41.59 
 
 		 383 aa  225  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  43.81 
 
 		 369 aa  225  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  37.4 
 
 		 387 aa  225  9e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  41.96 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  42.62 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  41.96 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  38.93 
 
 		 386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  38.52 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  44.64 
 
 		 331 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  38.94 
 
 		 368 aa  222  9e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  42.22 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  43.84 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  38.17 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  36.88 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  38.04 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  38.86 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  39.51 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.56 
 
 		 369 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  38.07 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  42.17 
 
 		 365 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  36.61 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  44.1 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  46.1 
 
 		 296 aa  219  7e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  39.04 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  35.82 
 
 		 442 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  39.1 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  36.63 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  35.44 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>