18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3667 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3667  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000021355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0659  protein of unknown function DUF327  55.7 
 
 
149 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3709700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0646  hypothetical protein  55.7 
 
 
149 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000332028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1618  hypothetical protein  54 
 
 
151 aa  157  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.26552  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1683  hypothetical protein  48.65 
 
 
149 aa  144  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1375  hypothetical protein  43.62 
 
 
150 aa  123  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00361251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0708  hypothetical protein  40.94 
 
 
148 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0160  protein of unknown function DUF327  40.98 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2106  hypothetical protein  26.28 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0159843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0041  hypothetical protein  27.59 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.255674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3914  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0158  protein of unknown function DUF327  26.45 
 
 
155 aa  52  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0450  hypothetical protein  24.83 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1183  hypothetical protein  25.83 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1942  hypothetical protein  26.47 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00412294  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1145  hypothetical protein  27 
 
 
152 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0035  protein of unknown function DUF327  28.04 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2250  protein of unknown function DUF327  25.49 
 
 
140 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.722735  hitchhiker  0.00505193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>