More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3660 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  67.76 
 
 
218 aa  311  4e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  68.22 
 
 
218 aa  311  4e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  65.52 
 
 
213 aa  268  6e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.07 
 
 
223 aa  228  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60.95 
 
 
213 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.85 
 
 
206 aa  209  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  55.22 
 
 
208 aa  202  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.1 
 
 
223 aa  179  3e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.65 
 
 
221 aa  167  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.83 
 
 
211 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.54 
 
 
236 aa  165  6e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
207 aa  164  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.91 
 
 
228 aa  162  2e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.94 
 
 
215 aa  163  2e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.46383e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.38 
 
 
210 aa  163  2e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44 
 
 
211 aa  162  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.21 
 
 
252 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.11 
 
 
214 aa  162  5e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.09 
 
 
224 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.11 
 
 
221 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.84 
 
 
206 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.92 
 
 
220 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  41.92 
 
 
209 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.24 
 
 
206 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.51 
 
 
210 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  7.28866e-05 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.39 
 
 
217 aa  154  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.2 
 
 
206 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
344 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0246  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.3 
 
 
222 aa  152  3e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.64 
 
 
356 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.49 
 
 
211 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.55 
 
 
217 aa  151  6e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.72 
 
 
208 aa  151  6e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.72 
 
 
216 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.21 
 
 
207 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
219 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.6 
 
 
223 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.67 
 
 
206 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  43.09 
 
 
217 aa  147  1e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.49 
 
 
214 aa  147  2e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.3 
 
 
204 aa  147  2e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  41.92 
 
 
203 aa  147  2e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.03 
 
 
211 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.24 
 
 
218 aa  144  7e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  4.7745e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.4 
 
 
222 aa  144  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.3 
 
 
219 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1337  Thiamine-phosphate diphosphorylase  41.41 
 
 
203 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.07 
 
 
352 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.47 
 
 
202 aa  143  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.89 
 
 
219 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.97058e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  40.8 
 
 
204 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.7 
 
 
205 aa  142  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.4 
 
 
206 aa  142  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.61 
 
 
197 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.41 
 
 
213 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.12 
 
 
207 aa  141  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  41.84 
 
 
492 aa  141  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  41.21 
 
 
212 aa  140  2e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.5 
 
 
216 aa  139  2e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.42 
 
 
206 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.56 
 
 
343 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.02 
 
 
365 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
207 aa  139  5e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.13 
 
 
207 aa  138  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1139  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.96 
 
 
226 aa  138  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.123471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  36.68 
 
 
210 aa  138  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  9.01813e-06 
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
352 aa  137  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.95 
 
 
212 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.21 
 
 
379 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
346 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.89 
 
 
216 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1159  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.77 
 
 
212 aa  136  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.89 
 
 
206 aa  136  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.71 
 
 
346 aa  135  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.74 
 
 
215 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 
208 aa  135  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  38.59 
 
 
183 aa  135  6e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.80325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.82 
 
 
351 aa  135  7e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.09 
 
 
211 aa  134  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.11 
 
 
350 aa  134  1e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.32 
 
 
207 aa  134  1e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
352 aa  134  1e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  7.36904e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.51 
 
 
212 aa  134  1e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.6 
 
 
360 aa  133  2e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34670  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
225 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.31 
 
 
206 aa  132  4e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  43 
 
 
484 aa  132  4e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.27 
 
 
353 aa  132  4e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.31 
 
 
234 aa  132  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.68 
 
 
216 aa  132  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37 
 
 
207 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.58 
 
 
203 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1046  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.12 
 
 
218 aa  131  8e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1435  Thiamine-phosphate diphosphorylase  42.42 
 
 
203 aa  130  1e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00770563  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38 
 
 
350 aa  130  1e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.63 
 
 
213 aa  130  2e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.82 
 
 
351 aa  129  2e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0403  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.04 
 
 
211 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.647684  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.87 
 
 
216 aa  129  4e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>