77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3551 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  764    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  59.89 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  54.37 
 
 		 447 aa  424  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  52.59 
 
 		 368 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  54.74 
 
 		 460 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  34.5 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  34.4 
 
 		 384 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  34.4 
 
 		 384 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  34.4 
 
 		 392 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  34.4 
 
 		 392 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  34.4 
 
 		 392 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  34.4 
 
 		 392 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  34.4 
 
 		 392 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  33.06 
 
 		 386 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  33.15 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  35.17 
 
 		 378 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  31.32 
 
 		 382 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  30.16 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  30.62 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  31.18 
 
 		 379 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  32.65 
 
 		 386 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  30.22 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  30.52 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  31.82 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  31.03 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  31.18 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  31.03 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  29.71 
 
 		 378 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  31.49 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  31.29 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  32.29 
 
 		 402 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  29.68 
 
 		 383 aa  149  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  28.38 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  28.38 
 
 		 387 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  28.11 
 
 		 387 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  28.11 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  28.82 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  28.07 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  27.67 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  28.61 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  30.35 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  30.35 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  31.96 
 
 		 385 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  28.46 
 
 		 392 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  26.5 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  29.3 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  28.35 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  28.13 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  27.63 
 
 		 666 aa  87.8  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  26.6 
 
 		 672 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.82 
 
 		 675 aa  86.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  28.03 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 1186 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  25.67 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.95 
 
 		 647 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  26.42 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  25.67 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  22.82 
 
 		 387 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  23.85 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.11 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  26.49 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  21.8 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  25.69 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  25.13 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  25.51 
 
 		 395 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  22.7 
 
 		 379 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  21.95 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  22.62 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  23.2 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  24 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  24.88 
 
 		 932 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  23.19 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  26.56 
 
 		 934 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  29.45 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  26.54 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  23.06 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>