191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3531 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 339 aa  696    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 192 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  36.52 
 
 		 188 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 196 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  38.56 
 
 		 155 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 216 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  33.9 
 
 		 178 aa  86.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2057  LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 137 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1947  transcriptional regulator, ArsR family  43.36 
 
 		 119 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1872  LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 120 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  45.78 
 
 		 171 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2168  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  42.31 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0994  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 106 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  28.8 
 
 		 186 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0749  hypothetical protein  34.02 
 
 		 111 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2886  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 120 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0998  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0270  hypothetical protein  32.38 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4191  hypothetical protein  35.44 
 
 		 101 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  37.8 
 
 		 96 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 111 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 111 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1182  hypothetical protein  35.44 
 
 		 100 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  31.4 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5911  LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 115 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116094  decreased coverage  0.00152039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  41.67 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  32.95 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  32.95 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  32.95 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  32.95 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  32.95 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  32.95 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1240  transcriptional regulator  35 
 
 		 100 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  32.95 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 111 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 115 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1011  hypothetical protein  32.97 
 
 		 106 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  40.48 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1083  hypothetical protein  32.97 
 
 		 106 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4057  hypothetical protein  33.68 
 
 		 111 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0486506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  40.48 
 
 		 123 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 123 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0999  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  32.95 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3258  hypothetical protein  35.71 
 
 		 115 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317122  normal  0.791915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  32.95 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1162  hypothetical protein  33.75 
 
 		 101 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  40.48 
 
 		 111 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1115  hypothetical protein  33.75 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1838  LuxR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 122 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1088  hypothetical protein  34.62 
 
 		 116 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  32.39 
 
 		 254 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 115 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0035  hypothetical protein  27.96 
 
 		 116 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  32.86 
 
 		 79 aa  53.1  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 114 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 		 329 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 113 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4107  Protein of unknown function DUF2087  27.68 
 
 		 165 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7180  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 108 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1424  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 158 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.414948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 110 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1792  hypothetical protein  31.63 
 
 		 115 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 		 121 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0304  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 110 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00443787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0027  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 107 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.669383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0725  hypothetical protein  30.19 
 
 		 111 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 86 aa  49.7  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2663  hypothetical protein  31.91 
 
 		 114 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.525352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 131 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 108 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  35.71 
 
 		 184 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  37.31 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1516  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  28.86 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 		 115 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 		 127 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 115 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 146 aa  47  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3639  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 		 130 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 		 145 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 112 aa  46.6  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 122 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 118 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>