More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3528 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  51.3 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.75 
 
 		 210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  38.34 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.77 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  37.5 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  39.69 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.04 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  37.95 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  40.31 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.23 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.06 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  39.06 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.57 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.54 
 
 		 245 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.76 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  38.27 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  36.22 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.85 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  36.17 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 220 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  36.73 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  35.75 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.43 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.22 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  36.22 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.85 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  34.9 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  36.22 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.22 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  36.79 
 
 		 233 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  38.46 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  37.11 
 
 		 232 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  36.79 
 
 		 279 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  37.76 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  37.76 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  37.76 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  37.76 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  37.76 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  37.76 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  33.51 
 
 		 233 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  37.76 
 
 		 691 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  36.51 
 
 		 229 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.71 
 
 		 224 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.22 
 
 		 227 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.29 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.2 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.94 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  34.87 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  34.87 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  35.2 
 
 		 228 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  35.2 
 
 		 228 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  33.51 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  35.64 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  35.64 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  33.51 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  36.17 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  35.53 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  36.32 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.71 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  34.41 
 
 		 329 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  32.8 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.38 
 
 		 276 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  33.67 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.22 
 
 		 227 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  35.57 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  33.67 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  32.8 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.76 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  33.33 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  35.05 
 
 		 234 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.2 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  33.68 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  32.79 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.06 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.85 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.39 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  33.85 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  34.39 
 
 		 254 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 344 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  34.02 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.76 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.35 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.22 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.54 
 
 		 251 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  28.88 
 
 		 241 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  35.71 
 
 		 227 aa  98.6  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  36.32 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.38 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  35.26 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 319 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  32.14 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 349 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>