More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3524 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  248  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  45.95 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  44.95 
 
 		 119 aa  90.1  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  46.85 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  52.5 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  44.25 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  44.14 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  45.38 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  42.34 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  46.75 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  40.57 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  48.68 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  38.98 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  44.09 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  38.39 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  47.89 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  46.91 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  40.19 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  40.78 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  49.28 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2043  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  43.48 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  39.09 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  39.09 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  35.51 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  37.96 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  34.58 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  36.75 
 
 		 256 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  45.21 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.65 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  36.36 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27770  predicted transcriptional regulator  39.34 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0224211  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1805  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.665763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2081  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  32.2 
 
 		 333 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  36.04 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  32.38 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>