22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3491 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3491  GTPase or GTP-binding protein-like protein  100 
 
 
295 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0398  AAA ATPase  28.01 
 
 
287 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1427  AAA ATPase  33.68 
 
 
290 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0989  GTPase or GTP-binding protein-like protein  34.87 
 
 
371 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0849  hypothetical protein  35.45 
 
 
431 aa  92  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0769566 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0195  GTPase or GTP-binding protein  32.29 
 
 
421 aa  89.4  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1914  hypothetical protein  29.73 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1840  conserved hypothetical protein  27.55 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.545103  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0955  hypothetical protein  32.32 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1404  hypothetical protein  36.05 
 
 
425 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2475  GTPase or GTP-binding protein-like protein  33.33 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0041  hypothetical protein  27.68 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.395847  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0801  GTPase or GTP-binding protein-like protein  32.37 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0084  hypothetical protein  33.81 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2988  GTPase or GTP-binding protein-like protein  33.7 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2037  GTPase or GTP-binding protein-like protein  27.97 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.677011  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1123  hypothetical protein  36.59 
 
 
353 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0047  hypothetical protein  35.25 
 
 
353 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0075  hypothetical protein  31.71 
 
 
355 aa  53.1  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.109256 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30338  predicted protein  27.15 
 
 
429 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00161  Protein clp1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH19]  25.34 
 
 
546 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.619918  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03451  putative septum site-determining protein MinD  24.04 
 
 
275 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>