More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3484 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  52.19 
 
 		 759 aa  756    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  52.19 
 
 		 759 aa  756    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  75.37 
 
 		 752 aa  1160    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  52.72 
 
 		 759 aa  772    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  48.28 
 
 		 759 aa  679    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1010  malic enzyme  48.12 
 
 		 765 aa  663    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0551739 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0224  malic enzyme  46.12 
 
 		 773 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  50.2 
 
 		 773 aa  696    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  48.66 
 
 		 781 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4759  malic enzyme  47.59 
 
 		 770 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4106  malic enzyme  47.18 
 
 		 770 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  48.07 
 
 		 756 aa  693    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2100  malic enzyme  48.66 
 
 		 774 aa  663    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  46.34 
 
 		 759 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1017  malic enzyme  47.99 
 
 		 774 aa  679    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0396  malic enzyme  48.14 
 
 		 769 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113138  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  48.4 
 
 		 779 aa  704    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4071  malic enzyme  48.07 
 
 		 776 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1095  malic enzyme  48.78 
 
 		 766 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3476  malic enzyme  48.14 
 
 		 769 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0622  malic enzyme  47.18 
 
 		 777 aa  654    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0117628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2477  malic enzyme  48.14 
 
 		 769 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.622597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  48.07 
 
 		 756 aa  693    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3439  malic enzyme  48.14 
 
 		 771 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  49.73 
 
 		 751 aa  708    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  48.07 
 
 		 756 aa  693    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  47.26 
 
 		 779 aa  680    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0666  malic enzyme  48.53 
 
 		 759 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  49.73 
 
 		 758 aa  686    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  50 
 
 		 777 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2847  malic enzyme  47.8 
 
 		 774 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  48.72 
 
 		 763 aa  692    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  53.26 
 
 		 763 aa  773    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  49.33 
 
 		 764 aa  725    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  48.07 
 
 		 773 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3474  malic enzyme  48.14 
 
 		 769 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  48.46 
 
 		 757 aa  692    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  56.99 
 
 		 783 aa  843    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  48.07 
 
 		 756 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  49.73 
 
 		 759 aa  709    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  51.93 
 
 		 766 aa  775    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  48.34 
 
 		 756 aa  698    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3713  malic enzyme  49.73 
 
 		 785 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302892  normal  0.094119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2662  malic enzyme  47.02 
 
 		 782 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  79.76 
 
 		 752 aa  1245    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  79.76 
 
 		 752 aa  1209    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  48.07 
 
 		 756 aa  693    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1112  malic enzyme  49.33 
 
 		 769 aa  685    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  100 
 
 		 749 aa  1529    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  49.87 
 
 		 753 aa  709    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1189  malic enzyme  48.53 
 
 		 768 aa  668    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  48.47 
 
 		 756 aa  692    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  57.24 
 
 		 771 aa  824    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0029  malic enzyme  49.12 
 
 		 761 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328842 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  51.55 
 
 		 754 aa  707    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  46.05 
 
 		 769 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  47.64 
 
 		 758 aa  679    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  49.13 
 
 		 754 aa  717    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0984  malic enzyme  47.99 
 
 		 774 aa  679    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  47.27 
 
 		 769 aa  674    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1424  malic enzyme  47.14 
 
 		 771 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  50.33 
 
 		 754 aa  746    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  49.12 
 
 		 767 aa  690    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3143  malic enzyme  48.33 
 
 		 760 aa  663    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.231587  normal  0.133413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  48.87 
 
 		 760 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0557  malic enzyme  49 
 
 		 779 aa  680    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3355  malic enzyme  49 
 
 		 772 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1256  malic enzyme  48.14 
 
 		 769 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1558  malic enzyme  46.85 
 
 		 770 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0734911  normal  0.266658 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  48.07 
 
 		 756 aa  693    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2110  malic enzyme  46.26 
 
 		 765 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  47.4 
 
 		 777 aa  677    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  49.6 
 
 		 773 aa  701    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  51.4 
 
 		 759 aa  718    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1573  malic enzyme  46.63 
 
 		 759 aa  651    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  49.06 
 
 		 751 aa  682    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  49.53 
 
 		 754 aa  695    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0148  malic enzyme  49.2 
 
 		 785 aa  673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  48.34 
 
 		 756 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  51.98 
 
 		 753 aa  721    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1536  malic enzyme  48.05 
 
 		 770 aa  673    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4030  malic enzyme  49.32 
 
 		 761 aa  717    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  55.94 
 
 		 757 aa  826    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  50.8 
 
 		 755 aa  717    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  48.07 
 
 		 756 aa  693    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0807  malic enzyme  47.77 
 
 		 768 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  48.32 
 
 		 776 aa  727    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  49 
 
 		 764 aa  733    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  47.25 
 
 		 758 aa  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  48.45 
 
 		 761 aa  674    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  48.79 
 
 		 756 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0532  malic enzyme  49.2 
 
 		 766 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4462  malic enzyme  46.64 
 
 		 766 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  50 
 
 		 751 aa  695    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  48.34 
 
 		 756 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0631  malic enzyme  49.2 
 
 		 785 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3496  malic enzyme  46.77 
 
 		 766 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  62 
 
 		 757 aa  906    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  56.42 
 
 		 773 aa  827    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3309  malic enzyme  48.14 
 
 		 769 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>