179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3446 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  320  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  74.03 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  68.87 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  68.21 
 
 		 173 aa  224  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  65.58 
 
 		 154 aa  223  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  64.71 
 
 		 163 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  64.9 
 
 		 158 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  60.65 
 
 		 165 aa  201  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  54.97 
 
 		 152 aa  181  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  58.55 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  55.26 
 
 		 158 aa  179  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  56.95 
 
 		 153 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  55.92 
 
 		 153 aa  176  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  55.92 
 
 		 153 aa  176  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  55.92 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3203  protein of unknown function DUF55  53.95 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  55.63 
 
 		 153 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  55.63 
 
 		 153 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  55.63 
 
 		 153 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0037  hypothetical protein  53.33 
 
 		 157 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  54.9 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  54.97 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  52.32 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  52.6 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01784  hypothetical protein  54.67 
 
 		 182 aa  169  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.280348  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  50.65 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  47.68 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  47.68 
 
 		 152 aa  165  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2770  protein of unknown function DUF55  53.64 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0051852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  53.33 
 
 		 155 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00302  hypothetical protein  54 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  51.66 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1180  hypothetical protein  51.32 
 
 		 154 aa  160  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1030  protein of unknown function DUF55  52.63 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  49.68 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0836  hypothetical protein  54.05 
 
 		 194 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0815  hypothetical protein  52.03 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0614  hypothetical protein  48.34 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.78998  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2507  hypothetical protein  53.38 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2375  hypothetical protein  53.38 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2674  hypothetical protein  49.66 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0831  hypothetical protein  54.05 
 
 		 170 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  52.32 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2463  hypothetical protein  52.7 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.563467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0126  hypothetical protein  48.34 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1847  hypothetical protein  52.7 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2323  hypothetical protein  45.7 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.300007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2458  hypothetical protein  52.7 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  48.99 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0843  hypothetical protein  46.36 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5789  hypothetical protein  52.7 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0781  protein of unknown function DUF55  50 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0209669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0961  hypothetical protein  46.36 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02383  hypothetical protein  49.01 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2149  hypothetical protein  45.95 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1025  hypothetical protein  52.7 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000631398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1032  hypothetical protein  52.7 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2330  hypothetical protein  52.7 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0213902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2956  hypothetical protein  52.7 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1642  hypothetical protein  52.7 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1184  hypothetical protein  52.7 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  49.68 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2669  hypothetical protein  48.99 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6859  protein of unknown function DUF55  48 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  45.75 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  45.75 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  50.33 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  50.33 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  47.02 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69050  hypothetical protein  49.67 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4934  protein of unknown function DUF55  48.99 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  49.67 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4026  hypothetical protein  52.7 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2217  hypothetical protein  50.68 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1167  hypothetical protein  43.04 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0155803  normal  0.011796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0992  protein of unknown function DUF55  50.68 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2792  hypothetical protein  50.68 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.495937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3282  protein of unknown function DUF55  46.36 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0784521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2834  hypothetical protein  48.98 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  48.39 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2927  hypothetical protein  46.1 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  49.02 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  48.34 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0651  hypothetical protein  49.32 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5229  hypothetical protein  47.02 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  44.37 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1663  protein of unknown function DUF55  47.26 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  50.98 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  47.02 
 
 		 140 aa  133  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2670  protein of unknown function DUF55  47.95 
 
 		 156 aa  133  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  47.06 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2212  protein of unknown function DUF55  47.95 
 
 		 178 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5113  hypothetical protein  49.01 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2403  hypothetical protein  45.95 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2092  hypothetical protein  46.58 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  49.02 
 
 		 137 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3972  hypothetical protein  44.52 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.766671  normal  0.0536087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  49.02 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  47.71 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  47.71 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>