107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3407 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  804    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  83.25 
 
 		 400 aa  678    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  79.25 
 
 		 400 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  77 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  67.25 
 
 		 399 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  42.61 
 
 		 377 aa  333  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  41.19 
 
 		 381 aa  329  4e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  43.5 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  43.53 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  42.25 
 
 		 397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  43.28 
 
 		 399 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  43.7 
 
 		 401 aa  311  9e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  43 
 
 		 380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  41.83 
 
 		 401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  41.83 
 
 		 401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  41.83 
 
 		 401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  41.83 
 
 		 401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  43.1 
 
 		 401 aa  305  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  41.58 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  41.58 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  42.04 
 
 		 397 aa  302  7.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  43.77 
 
 		 406 aa  296  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  42.89 
 
 		 401 aa  295  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  43 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  42.25 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  41.95 
 
 		 399 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  41.58 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 		 400 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  41.69 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  41.94 
 
 		 400 aa  259  7e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  41.44 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  33.08 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  25.77 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  23.91 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  22.71 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  21.77 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  23.91 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  23.08 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  22.25 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  23.39 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  27.08 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  23.5 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  21.93 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  21.1 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  21.84 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.14 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  25.31 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  26.14 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  20.05 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  20.1 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  21.9 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  22.52 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  22.74 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  20.43 
 
 		 378 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  22.52 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  22.28 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  22.28 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  21.95 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  26.67 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  22.28 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  22.28 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  22.03 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  22.49 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  22.28 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  22.03 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  22.59 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  22.59 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  21.27 
 
 		 354 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  25.11 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  25.11 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  28.18 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  22.25 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  21.81 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  21.63 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  28.83 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  21.63 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  21.63 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  21.63 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  21.46 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  23.21 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  24.7 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  27.14 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  30.48 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  21.55 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  21.55 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  24.7 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  22.14 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  26.27 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  29.57 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  24.32 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  23.08 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  22.38 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  21.03 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  27.03 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  20.71 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>