164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3400 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1030  metallo-beta-lactamase family protein  63.18 
 
 		 282 aa  358  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00771484  hitchhiker  0.000295307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2714  metallo-beta-lactamase family protein  60.38 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.8 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  26.26 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  25.61 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  25.78 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  25.61 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.78 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  25.78 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  25.52 
 
 		 319 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  24.34 
 
 		 319 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  25.47 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.03 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  24.32 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  24.91 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  23.95 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  24.34 
 
 		 335 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  24.34 
 
 		 335 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 		 321 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.71 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  24.53 
 
 		 317 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  23.51 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  24.71 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  23.4 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  24.65 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  23.59 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  23.25 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.35 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  24.36 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  24.9 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  26.42 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  25.97 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  23.51 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  23.58 
 
 		 637 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  23.45 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  24.57 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.34 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  26.92 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  22.86 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  23.37 
 
 		 644 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  23.59 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  24.11 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  22.75 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  22.87 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  22.87 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  23.71 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  22.61 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  26.85 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  23.86 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  29.58 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  23.24 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  21.25 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  22.88 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  21.93 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  21.54 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  23.05 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  21.59 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  25.13 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  28.57 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  22.22 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.34 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  21.59 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  25.13 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  26.18 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  22.92 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  30.58 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  22.69 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  20.15 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  21.61 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  20.79 
 
 		 292 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>