241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3383 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  53.55 
 
 
190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  52.72 
 
 
190 aa  209  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  49.73 
 
 
202 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  48.91 
 
 
192 aa  204  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  51.91 
 
 
207 aa  204  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  52.72 
 
 
191 aa  202  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  52.97 
 
 
190 aa  202  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  50.82 
 
 
193 aa  194  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  53.04 
 
 
190 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  50.55 
 
 
191 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  47.03 
 
 
195 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  50.27 
 
 
195 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  47.57 
 
 
197 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  44.68 
 
 
195 aa  168  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  43.09 
 
 
191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  46.2 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  37.17 
 
 
192 aa  158  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  42.54 
 
 
193 aa  157  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  42.7 
 
 
198 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  41.44 
 
 
193 aa  155  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  45.11 
 
 
199 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  41.11 
 
 
191 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  41.53 
 
 
207 aa  150  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  35.68 
 
 
193 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  40 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  34.07 
 
 
200 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  38.33 
 
 
181 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  34.88 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  37.95 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  36.9 
 
 
244 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  37.58 
 
 
187 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  34.55 
 
 
251 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  37.16 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  38.55 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  36.22 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  35.64 
 
 
187 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  33.68 
 
 
185 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  34.73 
 
 
257 aa  104  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  33.85 
 
 
188 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  36.17 
 
 
242 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  34.22 
 
 
187 aa  101  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  39.18 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  32.45 
 
 
182 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  35.33 
 
 
183 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  35.42 
 
 
184 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  36.77 
 
 
197 aa  92  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  34.48 
 
 
245 aa  90.5  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  34.05 
 
 
189 aa  89  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  36 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  36 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  36.88 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  36 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 
257 aa  79  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  30.64 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  32.37 
 
 
253 aa  78.2  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  34.48 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  28.14 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  33.85 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  34.23 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  32.76 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  31.69 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  37.04 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  32 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2290  protein of unknown function DUF820  32.81 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  33.53 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  31.45 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  34.84 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  30.63 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  32.43 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  34.62 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  34.87 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  28.48 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4826  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0786797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  28.42 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1085  hypothetical protein  36.97 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  26.98 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  29.41 
 
 
188 aa  62  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3545  protein of unknown function DUF820  30.49 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  29.09 
 
 
205 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  27.56 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2361  hypothetical protein  26.92 
 
 
191 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5334  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.510489  normal  0.17641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3734  protein of unknown function DUF820  27.66 
 
 
223 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  29.75 
 
 
205 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  31.34 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  28.05 
 
 
193 aa  58.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  28.28 
 
 
204 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  34.75 
 
 
186 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2595  hypothetical protein  27.67 
 
 
230 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0392428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  29.66 
 
 
204 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  32.58 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  30.67 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2551  protein of unknown function DUF820  31.93 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  28.72 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  30.67 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  25.27 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2041  hypothetical protein  32.82 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  33.09 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>