More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3354 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  78.28 
 
 		 398 aa  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 396 aa  820    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  75.76 
 
 		 397 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  74.18 
 
 		 397 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  73.67 
 
 		 397 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  72.91 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  72.15 
 
 		 398 aa  591  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  64.56 
 
 		 396 aa  551  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  63.8 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  64.05 
 
 		 395 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  51.27 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  54.2 
 
 		 393 aa  451  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  54.08 
 
 		 396 aa  441  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  52.94 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  52.14 
 
 		 395 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  45.96 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  45.5 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  45.08 
 
 		 393 aa  358  9e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  44.87 
 
 		 461 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  43.6 
 
 		 398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  45.34 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  42.24 
 
 		 398 aa  348  7e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  42.46 
 
 		 395 aa  342  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  45.71 
 
 		 398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  45.26 
 
 		 400 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  40.9 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  37.5 
 
 		 396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  37.27 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  37.83 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  38.03 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  39.68 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  35.57 
 
 		 404 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  35.61 
 
 		 405 aa  226  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  35.16 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  32.79 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  33.6 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  32.52 
 
 		 389 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  30.38 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  29.84 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  29.84 
 
 		 375 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  29.58 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  32.99 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  29.37 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 		 375 aa  166  8e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  29.09 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  29.51 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  28.95 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  28.95 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  29.29 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  28.97 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  31.61 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  28.46 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  29.33 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  30.68 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  27.98 
 
 		 402 aa  156  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  29.02 
 
 		 396 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  30.13 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  30.25 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  30.25 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  29.81 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  28.78 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  27.82 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  28.76 
 
 		 390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  29.33 
 
 		 379 aa  152  8e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  29.76 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  31.45 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  30.59 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.32 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  30.32 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  29.26 
 
 		 368 aa  150  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  29.2 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30.32 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  30.05 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 396 aa  149  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  29.73 
 
 		 397 aa  149  7e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  28.19 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  30.05 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  30.05 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  30.05 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  30.05 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  30.05 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1531  aminotransferase class I and II  29.4 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.543061  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  29.11 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  29.36 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2538  aminotransferase class I and II  28.91 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.408129  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  28.98 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  29.14 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  29.44 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  28.49 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  28.76 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>