101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3338 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  100 
 
 		 133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  76.3 
 
 		 136 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  50.81 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  44.88 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  47.01 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  44.53 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  45.38 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  46.46 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  47.01 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  44.54 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  45.26 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  44.12 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  45.45 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  42.52 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  44 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  43.31 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  40.46 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  44.8 
 
 		 136 aa  97.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  43.38 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  46.83 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  40.6 
 
 		 147 aa  94.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  40.77 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  40.46 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  43.33 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  45.08 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  38.64 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  47.9 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  39.39 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  39.69 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  44.7 
 
 		 180 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  44.7 
 
 		 180 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  44.7 
 
 		 180 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  42.74 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  43.38 
 
 		 185 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  40.44 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  45.97 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  47.58 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  39.17 
 
 		 130 aa  87.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  36.59 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  44.63 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  45.53 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  44.72 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  41.32 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  42.52 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  39.83 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  40.62 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  37.9 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  32.86 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  34.13 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  39.51 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  31.4 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  29.79 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  32.54 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  26.43 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  29.79 
 
 		 145 aa  48.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  34.17 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  32.84 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  30.95 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.4 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  33.61 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.01 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3783  DoxX family protein  33.58 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  29.58 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3834  DoxX family protein  33.33 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  27.87 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  33.61 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  30 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  30.15 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  27.89 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  28.89 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2386  DoxX family protein  30.3 
 
 		 156 aa  43.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  34.07 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  30.25 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  30.71 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  27.42 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  32 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  31.73 
 
 		 154 aa  42  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  31.43 
 
 		 144 aa  42  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  27.14 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  31.15 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  30.3 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  30.58 
 
 		 144 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  34.74 
 
 		 137 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  32.81 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  32.81 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  34.65 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  28.28 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  32.47 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  29.46 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  27.14 
 
 		 145 aa  40.8  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  27.27 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  34.48 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  30 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  27.14 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  28.57 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  26.81 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  32.47 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  34.83 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>