More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3316 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  66.15 
 
 
519 aa  636    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
692 aa  1392    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.2 
 
 
1272 aa  558  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.44 
 
 
1212 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.57 
 
 
1158 aa  361  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.65 
 
 
836 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  42 
 
 
1151 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.13 
 
 
835 aa  336  9e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  45.37 
 
 
818 aa  335  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.89 
 
 
835 aa  333  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.37 
 
 
835 aa  332  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.52 
 
 
639 aa  321  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.62 
 
 
1217 aa  306  7e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0486  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.13 
 
 
742 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.690821  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.06 
 
 
547 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.16 
 
 
625 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.02 
 
 
1336 aa  300  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  44.82 
 
 
840 aa  298  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.85 
 
 
466 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.471806  normal  0.498219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 
1085 aa  291  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.41 
 
 
775 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879852  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  48.3 
 
 
1096 aa  273  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.54 
 
 
1383 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.41 
 
 
594 aa  252  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1944  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.85 
 
 
638 aa  238  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3558  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.2 
 
 
450 aa  233  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0274  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.03 
 
 
440 aa  223  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2479  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.62 
 
 
769 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.31 
 
 
995 aa  217  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  36.41 
 
 
397 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  35.7 
 
 
397 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  35.7 
 
 
397 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  35.7 
 
 
397 aa  205  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  35.7 
 
 
397 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  35.7 
 
 
397 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  35.93 
 
 
397 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  35.46 
 
 
397 aa  204  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  35.7 
 
 
397 aa  204  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.03 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.7 
 
 
583 aa  197  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.17 
 
 
397 aa  193  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  42.91 
 
 
495 aa  187  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.81 
 
 
1876 aa  187  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.41 
 
 
490 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3698  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.74 
 
 
748 aa  183  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2053  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.42 
 
 
777 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.04 
 
 
487 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.96 
 
 
612 aa  177  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.48 
 
 
1092 aa  177  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.92 
 
 
577 aa  174  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.03 
 
 
639 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.97 
 
 
587 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.05 
 
 
587 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.86 
 
 
1029 aa  170  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.24 
 
 
805 aa  168  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2156  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.58 
 
 
401 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.43 
 
 
627 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.86 
 
 
771 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  41.88 
 
 
692 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0379  serine metalloprotease precursor  38.16 
 
 
502 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764372  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.23 
 
 
579 aa  164  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1101  serine metalloprotease  39 
 
 
500 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0573282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2709  serine metalloprotease  39 
 
 
497 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  39 
 
 
497 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.77 
 
 
680 aa  161  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5185  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  35.11 
 
 
605 aa  160  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.65 
 
 
370 aa  160  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10331  hypothetical protein  38.23 
 
 
482 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.1 
 
 
479 aa  158  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32 
 
 
724 aa  157  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  38.24 
 
 
560 aa  157  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.57 
 
 
452 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.95 
 
 
648 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.11 
 
 
587 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.9 
 
 
653 aa  154  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  30.05 
 
 
606 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.43 
 
 
754 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234127  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.69 
 
 
1454 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  32.21 
 
 
399 aa  152  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.76 
 
 
638 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.97 
 
 
557 aa  152  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1096  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.9 
 
 
589 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.9 
 
 
589 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  49.41 
 
 
1672 aa  150  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.53 
 
 
453 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.95 
 
 
721 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  45.23 
 
 
1626 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.46 
 
 
1673 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0340  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.35 
 
 
624 aa  147  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  34.2 
 
 
485 aa  145  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 
615 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
636 aa  144  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.382458 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1707  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  35.8 
 
 
737 aa  144  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2524  subtilisin-like serine protease  31.68 
 
 
1116 aa  143  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.07 
 
 
595 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 
797 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.73 
 
 
1372 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  46.25 
 
 
3911 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1582  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.63 
 
 
501 aa  140  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.45 
 
 
498 aa  140  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>