22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3286 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3286  water stress/hypersensitive response protein  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000209158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  56.17 
 
 		 165 aa  200  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  54.94 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2480  putative lipoprotein  52.69 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.30613e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2373  putative lipoprotein  48.5 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1164  water stress/hypersensitive response protein  44.85 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2935  late embryogenesis abundant protein 2  25.16 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0080  hypothetical protein  23.35 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.669106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0098  Late embryogenesis abundant protein 2  22.75 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0086  Late embryogenesis abundant protein 2  22.75 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0079  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  26.43 
 
 		 276 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.801419  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0384  hypothetical protein  30.51 
 
 		 277 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  25.66 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0413  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.5 
 
 		 280 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  26.52 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2756  water stress/hypersensitive response protein  19.31 
 
 		 264 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0956  water stress/hypersensitive response protein  25 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3438  Late embryogenesis abundant protein 2  23.36 
 
 		 304 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.370192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  24.26 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0412  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  25.64 
 
 		 280 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0619  hypothetical protein  24.46 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00260364  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0750  hypothetical protein  25.15 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.864897  normal  0.55506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>