More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3280 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 267 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  69.47 
 
 		 264 aa  364  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  69.47 
 
 		 267 aa  363  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  68.7 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  69.08 
 
 		 269 aa  338  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  59.54 
 
 		 267 aa  322  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  58.62 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  53.59 
 
 		 270 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 272 aa  255  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  54.01 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  49.81 
 
 		 271 aa  250  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  50.57 
 
 		 277 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  49.62 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  50.19 
 
 		 278 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  49.81 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  50.41 
 
 		 269 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  48.3 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  49.81 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  49.43 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  49.39 
 
 		 267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  51.26 
 
 		 268 aa  241  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  44.23 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  47.21 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  52.32 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  50.41 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  50.41 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  42.91 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  47.58 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  50.85 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  51.9 
 
 		 270 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2156  tryptophan synthase subunit alpha  51.92 
 
 		 272 aa  238  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156155  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  47.58 
 
 		 278 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 273 aa  238  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1683  tryptophan synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  49.06 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  49.58 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  52.44 
 
 		 266 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 271 aa  235  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  46.3 
 
 		 279 aa  234  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  47.1 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  48.08 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  50.19 
 
 		 265 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  47.92 
 
 		 263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  48.69 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  49.15 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 		 278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  49.79 
 
 		 279 aa  232  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  47.01 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  47.86 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  50.75 
 
 		 268 aa  231  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  48.76 
 
 		 265 aa  231  8.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  48.31 
 
 		 271 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  47.25 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  47.08 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  46.82 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  47.58 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  48.1 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  44.79 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  50.57 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  46.99 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  48.12 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  45.95 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  48.31 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  48.31 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  47.47 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  46.13 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  48.79 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  48.18 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  46.86 
 
 		 269 aa  228  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  48.64 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  46.41 
 
 		 279 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  47.94 
 
 		 271 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  46.41 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  48.82 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  46.49 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  44.49 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  50.42 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  51.68 
 
 		 281 aa  225  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 272 aa  225  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  44.87 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  49.07 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2305  tryptophan synthase subunit alpha  51.71 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00651609  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  50.42 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  47.57 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1719  tryptophan synthase subunit alpha  51.71 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2443  tryptophan synthase subunit alpha  51.71 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196043  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0531  tryptophan synthase subunit alpha  51.71 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1860  tryptophan synthase subunit alpha  51.71 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  45.99 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1651  tryptophan synthase subunit alpha  51.71 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>