More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3185 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
297 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  39.31 
 
 
302 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  44.14 
 
 
319 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 
304 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6266  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2894  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
303 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
298 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
300 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
305 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
279 aa  112  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.82 
 
 
722 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
346 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
305 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
303 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
346 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
311 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
282 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
314 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
401 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  27.35 
 
 
291 aa  99.4  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  26.61 
 
 
283 aa  99.4  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
318 aa  99  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
341 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  28.8 
 
 
320 aa  96.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  22.49 
 
 
342 aa  95.9  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 
325 aa  92.4  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  24.83 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  28.4 
 
 
330 aa  90.5  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 
337 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  27.51 
 
 
338 aa  89.7  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.82 
 
 
322 aa  89  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
679 aa  89  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
337 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
624 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  21.71 
 
 
342 aa  86.7  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
319 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  25.97 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
616 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  23.63 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  25.6 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  24.08 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  22.93 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
1739 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  23.35 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  26.88 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
824 aa  80.1  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  24.5 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  21.16 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
328 aa  79  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  20.87 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 
970 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
841 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  24.05 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  23.76 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  22.03 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  22.16 
 
 
347 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  22.08 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25.9 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  23.01 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>