139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3157 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  400  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  74.87 
 
 
199 aa  308  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  74.49 
 
 
200 aa  300  8.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  71.65 
 
 
195 aa  289  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  67.68 
 
 
196 aa  286  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  60.82 
 
 
198 aa  254  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  62.12 
 
 
198 aa  248  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  33.17 
 
 
300 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  32.58 
 
 
302 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  32.41 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  31.69 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  35.62 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  28.98 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  28.98 
 
 
300 aa  78.2  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  30.52 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  31.33 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  31.11 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  29.61 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  32 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  30.34 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  32.37 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  28.22 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  31.58 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  31.71 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  30 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  31.1 
 
 
283 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  30.34 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  30.29 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  30.77 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  32.64 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  28.89 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  29.89 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  32.47 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  28.89 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  29.08 
 
 
264 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  27.81 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  27.81 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  27.59 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  28.86 
 
 
218 aa  62.8  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  29.41 
 
 
232 aa  61.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  29.59 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  24.08 
 
 
213 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  26.44 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  23.49 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  32.21 
 
 
251 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  29.41 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  36.21 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  31.4 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  24.52 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  36.52 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  26 
 
 
196 aa  52  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  24.48 
 
 
206 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  36.51 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  38.89 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  30.18 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  29.02 
 
 
236 aa  49.3  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  22.93 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  23.57 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  29.5 
 
 
251 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  25 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1816  hypothetical protein  44.44 
 
 
166 aa  48.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0359339  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  30.71 
 
 
280 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  32.91 
 
 
262 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  26.13 
 
 
375 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  25.17 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  26.13 
 
 
375 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  26.13 
 
 
375 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  21.58 
 
 
205 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  41.38 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  22.89 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  25.86 
 
 
247 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  27.5 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  21.58 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  25.61 
 
 
225 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  29.73 
 
 
275 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  28.99 
 
 
262 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  23.7 
 
 
235 aa  46.2  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  23.43 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  39.66 
 
 
262 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  23.5 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  37.35 
 
 
264 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  39.66 
 
 
262 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  28.47 
 
 
251 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  27.17 
 
 
279 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  22.86 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  22.86 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  22.86 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  29.66 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  22.86 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  29.17 
 
 
244 aa  45.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  26.67 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  22.86 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  23.08 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  26.67 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  28.23 
 
 
284 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  38.1 
 
 
280 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  26.97 
 
 
250 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  36.36 
 
 
264 aa  45.1  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.26 
 
 
256 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  36.51 
 
 
262 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>