More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3152 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  100 
 
 		 240 aa  475  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  62.83 
 
 		 232 aa  261  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  64.16 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  58.56 
 
 		 246 aa  248  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  57.02 
 
 		 248 aa  241  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  49.56 
 
 		 377 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  46.4 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  44.95 
 
 		 223 aa  189  5e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  48.18 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  43.86 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  47.27 
 
 		 383 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.22 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  47.27 
 
 		 383 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  43.75 
 
 		 246 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  48.1 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  40.99 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  47.2 
 
 		 282 aa  176  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  44.49 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  44.39 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  37.28 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  46.61 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  42.04 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  43.38 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  41.59 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  47.76 
 
 		 240 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  46.49 
 
 		 235 aa  171  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  41.85 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  39.47 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  42.72 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  45.58 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  43.48 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  40.18 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  38.86 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  44.49 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  41.15 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  39.17 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  37.78 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  37.5 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  46.89 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  42.15 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  39.91 
 
 		 226 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  40 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  37.39 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  43.93 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  40.44 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  38.12 
 
 		 243 aa  162  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  39.53 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  38.12 
 
 		 243 aa  162  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  37.99 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  38.67 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  41.59 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  38.22 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  43.26 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  34.82 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  42.58 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  36.32 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  35.68 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  39.11 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  39.64 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  42.98 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  39.82 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  39.82 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  38.96 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  38.96 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  41.74 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  43.98 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  41.96 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  42.92 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  42.92 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  39.71 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  42.92 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  42.31 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  37.34 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  35.56 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  42.92 
 
 		 235 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  40.38 
 
 		 245 aa  154  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  39.73 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  42.54 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  43.06 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  43.18 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  39.3 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  40.77 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  38.71 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  37.9 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  37.44 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  42.73 
 
 		 227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  39.63 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  40.83 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  46.73 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  39.46 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  42.86 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  39.9 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  39.9 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  43.63 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  42.99 
 
 		 241 aa  151  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  39.9 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  39.9 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  39.9 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  42.27 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  36.24 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>