207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3148 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2224  response regulator  58.79 
 
 		 561 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  62.06 
 
 		 592 aa  696    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  60.2 
 
 		 604 aa  689    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  100 
 
 		 567 aa  1133    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  45.62 
 
 		 532 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1407  two component signal transduction response regulator  38.66 
 
 		 535 aa  322  9.000000000000001e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.301993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  61.5 
 
 		 379 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  43.37 
 
 		 332 aa  246  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  56.5 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  30 
 
 		 395 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  30.5 
 
 		 591 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  30.8 
 
 		 398 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  30.77 
 
 		 407 aa  87  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  30.27 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  30.27 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  29.23 
 
 		 581 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  31.43 
 
 		 600 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  28.5 
 
 		 570 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  28.98 
 
 		 597 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  31.36 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  29.59 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  28.98 
 
 		 570 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  30.59 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  27.59 
 
 		 273 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  31.58 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  31.03 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  25 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  26.95 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  27.82 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  31.86 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  31.86 
 
 		 426 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.21 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.21 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  26.47 
 
 		 438 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  26.47 
 
 		 438 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  26.47 
 
 		 424 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 470 aa  53.9  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  32.06 
 
 		 769 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 628 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 		 771 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  23.03 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 		 771 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 		 772 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 		 771 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 		 771 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 		 771 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 695 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  30.15 
 
 		 695 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  23.16 
 
 		 366 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.58 
 
 		 470 aa  51.2  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 794 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0249  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.86 
 
 		 834 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448202  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 794 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 1022 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0270  General secretory system II protein E domain protein  29.41 
 
 		 841 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126795  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 121 aa  50.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.57 
 
 		 456 aa  50.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29290  hybrid histidine protein kinase  39.47 
 
 		 826 aa  50.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0064  hypothetical protein  28.12 
 
 		 898 aa  50.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  28.48 
 
 		 1834 aa  50.4  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0063  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.56416e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0080  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.59 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.17 
 
 		 1119 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 727 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  32.65 
 
 		 853 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002813  flagellar regulatory protein FleQ  32.17 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 244 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0230  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1398  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 123 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 139 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  33.67 
 
 		 544 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0479  hypothetical protein  28.57 
 
 		 373 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.582539  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 180 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1989  response regulator receiver domain-containing protein  34.26 
 
 		 126 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 791 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03164  hypothetical protein  31.3 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 214 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  24.41 
 
 		 366 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.1 
 
 		 231 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.04 
 
 		 225 aa  48.5  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1974  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 126 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1889  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 126 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1179  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 457 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.655382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1959  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 493 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 468 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428008  normal  0.0222917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 727 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 519 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 991 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.34 
 
 		 560 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00120985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5548  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 849 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.646802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 		 656 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 1101 aa  47.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0259  General secretory system II protein E domain protein  28.76 
 
 		 841 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1017  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 460 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0996419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 608 aa  47.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50180  two-component response regulator  37.62 
 
 		 473 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  hitchhiker  0.00555849 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2310  sigma-54 dependent response regulator  32.17 
 
 		 478 aa  47  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 662 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 727 aa  47  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>