More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3131 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  78.16 
 
 		 87 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  82.76 
 
 		 87 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  82.76 
 
 		 87 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  72.41 
 
 		 87 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  70.11 
 
 		 87 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  73.56 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  60.92 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  54.02 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  55.17 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  54.02 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  48.84 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  50.57 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  50 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 92 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  45.98 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  52.81 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 88 aa  67  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  45.45 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 84 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  66.6  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  48.15 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  44.83 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0001  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00020529  normal  0.124488 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  50 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>