More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3105 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  46.8 
 
 		 790 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  56.48 
 
 		 803 aa  926    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  100 
 
 		 764 aa  1571    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  52.61 
 
 		 481 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  52.56 
 
 		 1154 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  49.32 
 
 		 865 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  45.36 
 
 		 542 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  45.21 
 
 		 548 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  43.1 
 
 		 537 aa  416  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  45.43 
 
 		 548 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  45.43 
 
 		 548 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.43 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.74 
 
 		 541 aa  412  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  46.14 
 
 		 545 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  45.43 
 
 		 548 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.16 
 
 		 550 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.16 
 
 		 550 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.39 
 
 		 548 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  43.86 
 
 		 547 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  44.42 
 
 		 549 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.31 
 
 		 545 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  44.97 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.88 
 
 		 542 aa  398  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  43.79 
 
 		 542 aa  395  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  44.76 
 
 		 531 aa  395  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.55 
 
 		 552 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  45.27 
 
 		 532 aa  389  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.58 
 
 		 525 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  42.48 
 
 		 554 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  45.23 
 
 		 554 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.96 
 
 		 554 aa  389  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  44.01 
 
 		 526 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  44.93 
 
 		 556 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  39.68 
 
 		 530 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  42.69 
 
 		 542 aa  382  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  43.56 
 
 		 550 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  43.34 
 
 		 557 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.59 
 
 		 554 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.29 
 
 		 553 aa  360  6e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  41.46 
 
 		 539 aa  335  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2616  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  53.87 
 
 		 390 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0488176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1389  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  53.87 
 
 		 390 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0174  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  53.52 
 
 		 452 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286523  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0451  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  53.52 
 
 		 452 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0265499  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1125  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  53.52 
 
 		 452 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162779  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1475  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  54.06 
 
 		 437 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00398178  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1209  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  53.52 
 
 		 394 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.059657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3093  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  51.97 
 
 		 410 aa  307  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4311  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.79 
 
 		 1055 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1434  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  55.27 
 
 		 377 aa  299  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.82 
 
 		 2284 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1433  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  50.55 
 
 		 623 aa  273  8.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2098  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.59 
 
 		 299 aa  253  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.476029  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2602  putative acyltransferase  44.4 
 
 		 282 aa  230  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2512  putative acyltransferase  44.4 
 
 		 282 aa  230  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0839  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  45.78 
 
 		 299 aa  227  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1458  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  45.78 
 
 		 299 aa  227  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2155  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  45.78 
 
 		 299 aa  227  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.582901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1850  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  45.78 
 
 		 299 aa  227  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0428  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  45.78 
 
 		 299 aa  227  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0524  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  45.78 
 
 		 299 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2977  putative acyltransferase  43.98 
 
 		 264 aa  215  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  hitchhiker  0.0000388716 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0641  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.84 
 
 		 313 aa  207  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000153814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10280  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.64 
 
 		 309 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0189442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1080  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.79 
 
 		 313 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0336623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1343  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.59 
 
 		 319 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.374742  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0957  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.32 
 
 		 314 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.915141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2986  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.25 
 
 		 319 aa  193  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0669081  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3992  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.85 
 
 		 297 aa  190  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1971  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.13 
 
 		 313 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1644  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.5 
 
 		 309 aa  189  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1314  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.72 
 
 		 308 aa  187  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1289  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.72 
 
 		 308 aa  187  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.899199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0947  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  37.63 
 
 		 312 aa  187  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3675  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.26 
 
 		 314 aa  187  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0879975  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2015  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.63 
 
 		 293 aa  185  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1276  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.62 
 
 		 310 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00229731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3818  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.76 
 
 		 313 aa  184  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000579966  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1034  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  35.42 
 
 		 291 aa  184  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.24557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1155  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.79 
 
 		 311 aa  184  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0181  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.41 
 
 		 303 aa  184  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0124548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0138  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.89 
 
 		 293 aa  184  7e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.488001 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2073  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.19 
 
 		 314 aa  184  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0176  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.24 
 
 		 304 aa  183  9.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1602  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.66 
 
 		 307 aa  183  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3107  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.79 
 
 		 311 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000188768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4148  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.59 
 
 		 292 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0283843 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1087  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  38.41 
 
 		 310 aa  182  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.930156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3469  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  35.39 
 
 		 324 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122116  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3951  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.12 
 
 		 314 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1876  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.77 
 
 		 311 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1724  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  35.66 
 
 		 309 aa  180  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000284563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1059  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.93 
 
 		 310 aa  180  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000649823  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4573  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  36.7 
 
 		 321 aa  180  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124342  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2469  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  38.11 
 
 		 291 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1804  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.51 
 
 		 290 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3894  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  37.5 
 
 		 314 aa  179  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3703  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  37.5 
 
 		 314 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527854  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3900  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.5 
 
 		 314 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3990  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  37.5 
 
 		 314 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>