More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3059 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  100 
 
 
238 aa  498  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  54.2 
 
 
240 aa  283  2e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
244 aa  136  3e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  36.78 
 
 
239 aa  127  2e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  38.97 
 
 
280 aa  101  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.09 
 
 
764 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 
254 aa  79  7e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
511 aa  76.6  3e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
228 aa  73.2  3e-12  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
242 aa  71.6  1e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  38.75 
 
 
235 aa  69.3  6e-11  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
866 aa  68.9  7e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  41.89 
 
 
324 aa  68.9  7e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 
254 aa  66.2  4e-10  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  37.97 
 
 
1476 aa  65.1  9e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
238 aa  64.3  2e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
222 aa  63.2  3e-09  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  30.77 
 
 
263 aa  62.8  4e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 
244 aa  63.2  4e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.43 
 
 
248 aa  62.4  6e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
711 aa  62  8e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
710 aa  61.6  9e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
507 aa  61.2  1e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  28.67 
 
 
216 aa  61.6  1e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3844  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
192 aa  61.2  1e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
305 aa  61.2  1e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  40.28 
 
 
181 aa  60.8  2e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  2.89093e-05  hitchhiker  3.49979e-05 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
322 aa  60.1  3e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7834  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
316 aa  59.3  5e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  32.29 
 
 
1124 aa  59.3  5e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
233 aa  59.3  5e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
242 aa  58.9  6e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
706 aa  58.9  7e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  50.98 
 
 
243 aa  58.2  1e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
227 aa  58.2  1e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  50.98 
 
 
243 aa  58.2  1e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0046  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
236 aa  58.2  1e-07  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.260962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  50.98 
 
 
243 aa  58.2  1e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4893  hypothetical protein  30.36 
 
 
268 aa  57.4  2e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148209  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
324 aa  57.4  2e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
225 aa  57.8  2e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  41.89 
 
 
222 aa  57  3e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  26.28 
 
 
239 aa  56.2  4e-07  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.67 
 
 
232 aa  56.2  4e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  51.92 
 
 
237 aa  56.2  4e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
296 aa  56.2  4e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  34.57 
 
 
224 aa  55.8  5e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  26.77 
 
 
263 aa  55.8  6e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
196 aa  55.5  7e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1141  methyltransferase type 11  24.14 
 
 
236 aa  55.5  7e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  32.35 
 
 
213 aa  55.1  9e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.97 
 
 
345 aa  54.7  1e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  34.88 
 
 
255 aa  54.7  1e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
242 aa  55.1  1e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  35 
 
 
250 aa  54.7  1e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
243 aa  53.9  2e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
242 aa  54.3  2e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
238 aa  54.3  2e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
254 aa  53.9  2e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
257 aa  53.9  2e-06  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2348  hypothetical protein  21.56 
 
 
220 aa  54.3  2e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  47.06 
 
 
241 aa  53.5  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  23.64 
 
 
312 aa  53.1  3e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0777  methyltransferase type 11  21.65 
 
 
236 aa  53.5  3e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.621905  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
339 aa  53.5  3e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  23.87 
 
 
306 aa  53.1  3e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  35.05 
 
 
259 aa  53.5  3e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.76 
 
 
258 aa  52.8  5e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  45.1 
 
 
241 aa  52.4  6e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  25.19 
 
 
198 aa  52.4  7e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
194 aa  52.4  7e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
237 aa  52  7e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 
282 aa  52.4  7e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
238 aa  52  8e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  40 
 
 
246 aa  51.6  1e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  42.86 
 
 
230 aa  51.2  1e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
244 aa  51.2  1e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  27.55 
 
 
235 aa  51.6  1e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  36.47 
 
 
237 aa  51.2  1e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 
240 aa  51.2  1e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  23.98 
 
 
238 aa  51.6  1e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
333 aa  51.6  1e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.14 
 
 
275 aa  51.2  1e-05  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  32.98 
 
 
247 aa  51.6  1e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  30.69 
 
 
191 aa  51.6  1e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2280  hypothetical protein  35.42 
 
 
189 aa  51.6  1e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  24.79 
 
 
243 aa  50.8  2e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
311 aa  50.8  2e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
259 aa  50.8  2e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 
235 aa  50.8  2e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  30.43 
 
 
221 aa  50.8  2e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.26 
 
 
207 aa  50.4  2e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.47 
 
 
211 aa  50.8  2e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  48 
 
 
239 aa  50.4  2e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 
255 aa  50.8  2e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  36.05 
 
 
243 aa  50.8  2e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 
267 aa  50.8  2e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
261 aa  50.1  3e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 
275 aa  50.1  3e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  41.18 
 
 
240 aa  50.1  3e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>