More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3041 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
260 aa  523  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.38 
 
 
260 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.38 
 
 
260 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  71.92 
 
 
260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  58.85 
 
 
260 aa  310  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.3 
 
 
259 aa  277  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.91 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  53.31 
 
 
258 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  50.77 
 
 
260 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  50.38 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.69 
 
 
260 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.85 
 
 
260 aa  249  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.85 
 
 
260 aa  249  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  48.85 
 
 
260 aa  247  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.74 
 
 
260 aa  246  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  51.21 
 
 
258 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.46 
 
 
260 aa  245  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  51.41 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
260 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.08 
 
 
260 aa  234  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.45 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  49.22 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.36 
 
 
261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  51.61 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.51 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.69 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.54 
 
 
260 aa  231  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
259 aa  231  8.000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.46 
 
 
267 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.92 
 
 
260 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.92 
 
 
260 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.95 
 
 
260 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.98 
 
 
265 aa  226  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.15 
 
 
260 aa  226  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.36 
 
 
261 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  47.31 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 
261 aa  224  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  50.58 
 
 
256 aa  224  9e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.23 
 
 
269 aa  224  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.95 
 
 
259 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.29 
 
 
260 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45 
 
 
264 aa  222  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.41 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  47.01 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
253 aa  218  6e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.03 
 
 
258 aa  217  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.96 
 
 
258 aa  215  7e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  46.56 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.79 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.11 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  45 
 
 
260 aa  211  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.31 
 
 
267 aa  211  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  44.87 
 
 
257 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.25 
 
 
257 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.14 
 
 
259 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.92 
 
 
257 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
257 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.3 
 
 
257 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  43.36 
 
 
260 aa  208  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  43.3 
 
 
262 aa  207  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.21 
 
 
257 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.21 
 
 
257 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  43.51 
 
 
258 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
257 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.21 
 
 
257 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 
259 aa  206  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.74 
 
 
260 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 
258 aa  205  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.8 
 
 
266 aa  205  6e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  44.53 
 
 
260 aa  205  7e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
258 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
258 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  43.73 
 
 
257 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
257 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.06 
 
 
263 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.87 
 
 
258 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.92 
 
 
262 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.35 
 
 
258 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 
263 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  45.21 
 
 
257 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.15 
 
 
258 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 
261 aa  201  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 
257 aa  201  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  43.68 
 
 
262 aa  201  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.43 
 
 
257 aa  201  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  42.42 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.37 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  45.77 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 
259 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  44.8 
 
 
263 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  42.59 
 
 
258 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  45.2 
 
 
263 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>