More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3040 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  91.56 
 
 
379 aa  724  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
402 aa  830  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  92.35 
 
 
379 aa  731  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  91.56 
 
 
379 aa  725  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  55.03 
 
 
379 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.53 
 
 
381 aa  428  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.91 
 
 
379 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.35 
 
 
380 aa  417  1e-115  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  54.11 
 
 
379 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  53.32 
 
 
379 aa  411  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  53.85 
 
 
379 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86159e-14 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  53.85 
 
 
379 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  53.85 
 
 
379 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  53.58 
 
 
379 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.08426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  53.85 
 
 
379 aa  411  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.46 
 
 
379 aa  408  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.00384e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  53.58 
 
 
379 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.85 
 
 
379 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.58 
 
 
380 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  53.85 
 
 
379 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.42 
 
 
642 aa  407  1e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.32 
 
 
379 aa  407  1e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  53.44 
 
 
379 aa  404  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.12 
 
 
382 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.59 
 
 
379 aa  400  1e-110  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.94 
 
 
379 aa  399  1e-110  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.67 
 
 
394 aa  399  1e-110  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  51.59 
 
 
379 aa  399  1e-110  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  51.59 
 
 
379 aa  399  1e-110  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.62 
 
 
386 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.66 
 
 
379 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  55.56 
 
 
379 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.13 
 
 
400 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50 
 
 
380 aa  393  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  49.21 
 
 
379 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.19 
 
 
389 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.4 
 
 
380 aa  388  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.47 
 
 
379 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.79 
 
 
379 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.07 
 
 
376 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.59 
 
 
380 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
379 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.41 
 
 
380 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.32 
 
 
380 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.02 
 
 
380 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  47.48 
 
 
376 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.46 
 
 
377 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  47.48 
 
 
376 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  50 
 
 
379 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  47.48 
 
 
381 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3492  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.61 
 
 
383 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  47.75 
 
 
381 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  47.48 
 
 
376 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.93 
 
 
386 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  47.48 
 
 
376 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29924e-10 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  47.48 
 
 
376 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  47.75 
 
 
376 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.61 
 
 
383 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  47.75 
 
 
381 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.26 
 
 
381 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.21 
 
 
376 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2279  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.07 
 
 
383 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2885  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.61 
 
 
383 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25932  short chain acyl-coenzyme A dehydrogenase  48.82 
 
 
436 aa  375  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
380 aa  376  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.21 
 
 
379 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.26 
 
 
379 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.94 
 
 
380 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.66 
 
 
381 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.14865e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  47.45 
 
 
375 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.45 
 
 
641 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  47.45 
 
 
375 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.88 
 
 
380 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  45.31 
 
 
378 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.15 
 
 
377 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2192  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.88 
 
 
380 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  47.62 
 
 
377 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.88 
 
 
377 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1555  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.73 
 
 
383 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1769  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  48.67 
 
 
383 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.92 
 
 
375 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1665  butyryl-CoA dehydrogenase  47.62 
 
 
380 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3574  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.68 
 
 
377 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3106  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.06 
 
 
375 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.332334  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.62 
 
 
377 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.88 
 
 
377 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.62 
 
 
377 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.33 
 
 
379 aa  363  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000229425  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.62 
 
 
377 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2865  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.01 
 
 
383 aa  362  5e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509295  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.38 
 
 
375 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>