More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2991 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  100 
 
 		 169 aa  340  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  77.78 
 
 		 178 aa  251  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  76.97 
 
 		 162 aa  249  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  75.16 
 
 		 164 aa  249  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  71.6 
 
 		 163 aa  245  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  73.86 
 
 		 164 aa  245  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  75.82 
 
 		 164 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  73.2 
 
 		 157 aa  237  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  68.67 
 
 		 164 aa  216  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  66.24 
 
 		 164 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  67.32 
 
 		 164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  61.08 
 
 		 167 aa  209  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  64.54 
 
 		 171 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  58.11 
 
 		 161 aa  184  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  57.53 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  52.35 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  58.11 
 
 		 161 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  50 
 
 		 164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  51.68 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  47.62 
 
 		 181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  56.16 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  51.61 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  55.7 
 
 		 173 aa  174  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  52.41 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  51.03 
 
 		 192 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  50 
 
 		 194 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  50 
 
 		 194 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  45.75 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  48.3 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  46.04 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  44 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  47.52 
 
 		 194 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  46.81 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  46.81 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  43.59 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  41.94 
 
 		 180 aa  133  9e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  40.13 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  46.21 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  42.86 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  46.98 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  41.55 
 
 		 212 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  40.13 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  42.11 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  41.78 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  43.8 
 
 		 191 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  45.04 
 
 		 191 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  41.45 
 
 		 179 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  36.02 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.82 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  37.84 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  36.24 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  39.49 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  41.01 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  43.17 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  36.99 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  44.44 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  39.04 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  40.38 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  35.71 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  40 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  40.14 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  37.76 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  39.04 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  36.36 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  36.81 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  40.27 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  42.95 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  42.66 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  37.33 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  41.4 
 
 		 205 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  40.56 
 
 		 160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  37.09 
 
 		 167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  40.52 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  40.52 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  43.97 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  34 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  39.16 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  35.57 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  38.36 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  39.46 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  39.29 
 
 		 175 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  34.25 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  36.94 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  38.1 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  36.77 
 
 		 169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  38.46 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  38.36 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  35.71 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  38.67 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  36.05 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  37.41 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  37.41 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  38.56 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  34.84 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  31.82 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  34.25 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  39.29 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  34.9 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  33.56 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  33.56 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>