283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2860 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
274 aa  552  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  65.69 
 
 
274 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  66.79 
 
 
273 aa  341  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  64.84 
 
 
274 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  66.67 
 
 
274 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  56.2 
 
 
274 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  56.82 
 
 
272 aa  295  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  43.49 
 
 
272 aa  208  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  38.69 
 
 
277 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  37.23 
 
 
281 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  37.55 
 
 
291 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  41.79 
 
 
273 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  33.21 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  36.9 
 
 
291 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  36.51 
 
 
291 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  35.08 
 
 
291 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  36.21 
 
 
357 aa  143  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  33.58 
 
 
296 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
359 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 
317 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  30.29 
 
 
306 aa  133  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  31.6 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  35.87 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
288 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  31.84 
 
 
275 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  34.43 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  32.43 
 
 
304 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  32.68 
 
 
286 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 
287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 
317 aa  118  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  29.2 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  30.66 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 
292 aa  115  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 
304 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  31.93 
 
 
296 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  31.31 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  28.26 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 
285 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
277 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  31.23 
 
 
338 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  30.21 
 
 
288 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  34.47 
 
 
315 aa  108  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  32.83 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  30.12 
 
 
292 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  32.83 
 
 
296 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 
257 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 
288 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 
414 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
286 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  34.17 
 
 
267 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  39.74 
 
 
256 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  29.57 
 
 
283 aa  105  7e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  33.02 
 
 
319 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 
288 aa  105  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 
306 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 
306 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 
307 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  30.05 
 
 
243 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  31.84 
 
 
306 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 
288 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  33.78 
 
 
307 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  36.25 
 
 
249 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  36.25 
 
 
249 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  33.69 
 
 
331 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 
305 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  33.69 
 
 
331 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  33.69 
 
 
331 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  27.73 
 
 
336 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  26.74 
 
 
309 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 
285 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 
254 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 
348 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 
276 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 
305 aa  99.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 
356 aa  99.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  33.16 
 
 
329 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  28.9 
 
 
286 aa  99.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.29 
 
 
283 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25.29 
 
 
283 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  33.16 
 
 
330 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  35.05 
 
 
316 aa  99  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  26.44 
 
 
324 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  37.24 
 
 
249 aa  99  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
285 aa  99  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  28.16 
 
 
283 aa  99  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 
326 aa  98.6  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  36.25 
 
 
381 aa  98.6  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  34 
 
 
367 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  33.5 
 
 
355 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  27.76 
 
 
285 aa  97.8  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  25.58 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  33.67 
 
 
318 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 
348 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  36.09 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 
311 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>