195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2850 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  100 
 
 		 105 aa  220  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  74.74 
 
 		 104 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  67.35 
 
 		 101 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  62.89 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  73 
 
 		 101 aa  140  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  72 
 
 		 101 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  56.99 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  57.78 
 
 		 96 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  72 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  57.95 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  47.5 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  54 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  49.09 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  50.98 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  42.03 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  42.03 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  43.28 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  45.61 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  47.46 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  37.78 
 
 		 459 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  53.49 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  45.61 
 
 		 169 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  33.75 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  50 
 
 		 182 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  43.08 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 459 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 236 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 199 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  50 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  46.94 
 
 		 181 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  44 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  35.82 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  43.4 
 
 		 178 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 197 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  48 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  34.33 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  45.1 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 216 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  48 
 
 		 182 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  45.1 
 
 		 185 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  48 
 
 		 182 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  42.55 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  36.76 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  42.86 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  44 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 213 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  36.76 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  44.9 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  44 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 204 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  49.12 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  43.14 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  43.75 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  44.9 
 
 		 193 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  41.3 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  43.75 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  53.49 
 
 		 211 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  45.65 
 
 		 363 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  48.89 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  44.83 
 
 		 193 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  39.58 
 
 		 552 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  44 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  37.25 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  40.82 
 
 		 186 aa  47.4  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  44.19 
 
 		 174 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  44 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  45.16 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  44.19 
 
 		 186 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  37.68 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  37.25 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  39.66 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3190  hypothetical protein  34.38 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00361  HNH endonuclease:HNH nuclease  40.58 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  40.68 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 196 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  40.82 
 
 		 204 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  39.66 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  48.84 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  37.25 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>