283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2846 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
200 aa  408  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  64.21 
 
 
194 aa  265  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  66.31 
 
 
190 aa  264  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  65.24 
 
 
190 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  63.64 
 
 
189 aa  254  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  60.96 
 
 
189 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  63.1 
 
 
188 aa  249  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.69 
 
 
192 aa  247  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  60.43 
 
 
189 aa  246  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  58.06 
 
 
188 aa  244  6e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  56.84 
 
 
191 aa  240  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  60.43 
 
 
189 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.98 
 
 
189 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.67 
 
 
190 aa  232  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.61 
 
 
190 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  54.3 
 
 
190 aa  220  9e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  53.72 
 
 
190 aa  218  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.26 
 
 
189 aa  217  7e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.05 
 
 
195 aa  205  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  46.28 
 
 
189 aa  186  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  38.22 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  37.57 
 
 
209 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.33 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  36.17 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.33 
 
 
194 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  38.12 
 
 
195 aa  121  7e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.94 
 
 
186 aa  121  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.52 
 
 
186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  32.11 
 
 
185 aa  117  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  38.86 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.47 
 
 
215 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  32.47 
 
 
189 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  33.85 
 
 
186 aa  104  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.28 
 
 
187 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.12 
 
 
186 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  29.53 
 
 
192 aa  101  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  29.53 
 
 
192 aa  101  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  33.15 
 
 
187 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.16 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  31.08 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.13 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.65 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.59 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  28.26 
 
 
178 aa  72  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.07 
 
 
160 aa  72  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  33.08 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  26.97 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  26.97 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  27.27 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  25.77 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  29.93 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  26.97 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.08 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  34.62 
 
 
169 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  29.28 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  25.28 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1553  hypothetical protein  26.78 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  25.84 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  25.84 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  32.56 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  27.27 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  25.84 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  25.84 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.84 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  25.97 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  29.37 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  24.86 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.93 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  26.75 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  27.03 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  25.71 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  25.97 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.11 
 
 
180 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.34 
 
 
171 aa  63.2  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  30.53 
 
 
177 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  33.6 
 
 
184 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  28.57 
 
 
164 aa  61.6  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  30.56 
 
 
186 aa  61.6  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  32.26 
 
 
202 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  24.16 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  29.6 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  28.24 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  29.01 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  23.6 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  28.14 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.67 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  23.6 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.96 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  33.88 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06661  hypothetical protein  31.85 
 
 
229 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.88 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  28.1 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  27.47 
 
 
226 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.06 
 
 
180 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.84 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28 
 
 
199 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  34.23 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>