More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2836 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  100 
 
 		 340 aa  705    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1815  gas vesicle protein GvpN  63.21 
 
 		 308 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0692  ATPase  59.87 
 
 		 299 aa  391  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3031  gas vesicle protein GvpN  59.73 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  60.45 
 
 		 304 aa  355  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1255  gas vesicle protein GvpN  47.33 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1750  gas vesicle protein GvpN  45.51 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0076  ATPase associated with various cellular activities  48.89 
 
 		 418 aa  282  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0615822  decreased coverage  0.000700861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2334  gas vesicle protein GvpN  46.81 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2329  gas vesicle protein GvpN  44.9 
 
 		 311 aa  268  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399542 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0058  gas vesicle protein GvpN  44.01 
 
 		 351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0714681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  40.31 
 
 		 437 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2375  gas vesicle protein GvpN  39.73 
 
 		 347 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3582  ATPase  40.89 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3267  ATPase  40.89 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0883928  normal  0.16657 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0333  gas vesicle protein GvpN  43.32 
 
 		 373 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.48 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  30.21 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  25.52 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  29.08 
 
 		 275 aa  86.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  27.91 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.75 
 
 		 267 aa  86.3  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  27.75 
 
 		 267 aa  86.3  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  27.91 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  29.33 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  28.21 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.65 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  27.69 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.82 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  27.01 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  27.01 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  27.01 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  27.14 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.01 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  27.72 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  27.86 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  28.43 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  26.73 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  27.04 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.87 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  26.9 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  25.97 
 
 		 268 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.23 
 
 		 267 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  26.87 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.58 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  34.33 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  28.5 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  27.27 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  25.63 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  25.58 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  33.68 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.58 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  27.46 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  25.74 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  27.57 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  26.81 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  32.34 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.37 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  26.84 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  26.39 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  27.27 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  27.06 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  28.1 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  26.92 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  26.29 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.71 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  26.69 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  25.89 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  32.16 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  27.54 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  28.43 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  26.83 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.11 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  26.15 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  28.57 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  27.04 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  27.46 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  27.46 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  25.6 
 
 		 269 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.1 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  24.1 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.18 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  27.11 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  27.11 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  27.11 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  27.5 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  26.3 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.3 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  23.92 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.44 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  26.7 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  26.7 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  26.02 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.77 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  25.85 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.77 
 
 		 271 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  25.96 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  24.75 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.09 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  25 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>