More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2815 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  77.34 
 
 
694 aa  1138    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  49.49 
 
 
691 aa  707    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  84.07 
 
 
697 aa  1218    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  48.16 
 
 
692 aa  684    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.69 
 
 
697 aa  641    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  45.05 
 
 
693 aa  641    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  46.89 
 
 
698 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  76.33 
 
 
694 aa  1124    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  46.94 
 
 
692 aa  666    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  48.01 
 
 
697 aa  663    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  45.14 
 
 
699 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  46.41 
 
 
692 aa  669    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  47 
 
 
692 aa  668    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  46.71 
 
 
692 aa  665    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  46.71 
 
 
692 aa  665    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  47 
 
 
692 aa  668    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  48.09 
 
 
687 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  45.77 
 
 
694 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  45.63 
 
 
694 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  45.79 
 
 
688 aa  642    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  47 
 
 
692 aa  669    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  45.91 
 
 
696 aa  642    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  48.1 
 
 
689 aa  676    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  52.69 
 
 
692 aa  759    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  47.44 
 
 
691 aa  682    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  46.33 
 
 
697 aa  663    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  46.15 
 
 
697 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  45.59 
 
 
692 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  60.99 
 
 
692 aa  885    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  47.14 
 
 
692 aa  671    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  47.51 
 
 
692 aa  677    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  46.85 
 
 
692 aa  668    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.78 
 
 
700 aa  652    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  46.56 
 
 
692 aa  667    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  47.72 
 
 
692 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  82.93 
 
 
697 aa  1222    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  46.21 
 
 
692 aa  640    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  48.68 
 
 
686 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  46.71 
 
 
692 aa  665    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  46.32 
 
 
692 aa  655    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  47.81 
 
 
679 aa  669    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  46.81 
 
 
697 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  49.93 
 
 
680 aa  687    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  48.76 
 
 
692 aa  686    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  46.5 
 
 
695 aa  670    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  48.46 
 
 
685 aa  651    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  46.48 
 
 
697 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  45.8 
 
 
691 aa  641    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  78.89 
 
 
701 aa  1165    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  47.2 
 
 
689 aa  658    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  45.14 
 
 
699 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  46.69 
 
 
690 aa  650    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  47.6 
 
 
690 aa  665    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.87 
 
 
691 aa  658    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  48.24 
 
 
688 aa  660    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  47.6 
 
 
692 aa  672    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  44.78 
 
 
699 aa  642    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  47.72 
 
 
691 aa  643    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  100 
 
 
697 aa  1440    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  45.99 
 
 
689 aa  666    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  45.57 
 
 
701 aa  654    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  46.48 
 
 
692 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  44.93 
 
 
699 aa  643    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  48.17 
 
 
686 aa  673    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  46.26 
 
 
693 aa  652    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  79.17 
 
 
701 aa  1149    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  49.12 
 
 
689 aa  684    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  46.46 
 
 
691 aa  644    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  47.79 
 
 
691 aa  669    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  45.55 
 
 
692 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  45.19 
 
 
704 aa  636    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  47.21 
 
 
692 aa  664    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  45.73 
 
 
695 aa  650    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  45.93 
 
 
673 aa  639    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  46.33 
 
 
697 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  49.49 
 
 
682 aa  691    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  48.61 
 
 
691 aa  660    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  46.56 
 
 
692 aa  663    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  46.33 
 
 
702 aa  640    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  48.03 
 
 
691 aa  676    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  47.28 
 
 
691 aa  650    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  46.85 
 
 
693 aa  669    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  44.48 
 
 
692 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  48.03 
 
 
695 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  57.02 
 
 
691 aa  825    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  45.52 
 
 
707 aa  646    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  45.89 
 
 
697 aa  645    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  46.71 
 
 
692 aa  665    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  46.95 
 
 
688 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  47.02 
 
 
699 aa  633  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000315857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  44.33 
 
 
670 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  45.64 
 
 
699 aa  634  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  46.15 
 
 
697 aa  634  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3223  elongation factor G  45.78 
 
 
730 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45.89 
 
 
700 aa  631  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.48 
 
 
696 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  43.89 
 
 
692 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  44.77 
 
 
696 aa  631  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  45.41 
 
 
704 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  44.91 
 
 
673 aa  631  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>