92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2810 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  100 
 
 
198 aa  400  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  49.18 
 
 
193 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  48.04 
 
 
197 aa  175  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  43.98 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  44.39 
 
 
213 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  29.59 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  28.57 
 
 
223 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  26.32 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.89 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.92 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  30 
 
 
245 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.74 
 
 
189 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.08 
 
 
221 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  37.08 
 
 
221 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  38.3 
 
 
222 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  29.45 
 
 
207 aa  54.7  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  40.45 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.5 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  35.71 
 
 
252 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  38.04 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.08 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  35 
 
 
222 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  33.8 
 
 
242 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.2 
 
 
203 aa  51.6  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  25.89 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.17 
 
 
166 aa  51.2  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  34.83 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.3 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  31.82 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  31.82 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  32.86 
 
 
257 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  32.86 
 
 
257 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  38.2 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.26 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  34.29 
 
 
244 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01050  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase, putative  28.78 
 
 
257 aa  48.9  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442432  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.04 
 
 
189 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.04 
 
 
189 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.88 
 
 
215 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.04 
 
 
189 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  35.87 
 
 
210 aa  48.5  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.29 
 
 
189 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  33.33 
 
 
257 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.56 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.29 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  28.28 
 
 
279 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  33.33 
 
 
257 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.4 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.93 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.56 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.44 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.8 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.25 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  33.33 
 
 
257 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.05 
 
 
195 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  39.24 
 
 
214 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.87 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.29 
 
 
194 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3864  hypothetical protein  31.68 
 
 
174 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  27.96 
 
 
266 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  34.44 
 
 
1020 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  31.13 
 
 
219 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  39.19 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  27.05 
 
 
271 aa  44.7  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  35.8 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.29 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  35.8 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  39.51 
 
 
253 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.8 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  29.61 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.56 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.33 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.96 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  39.24 
 
 
216 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  33.06 
 
 
168 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.62 
 
 
220 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  28.38 
 
 
244 aa  42  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.86 
 
 
207 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  28.17 
 
 
243 aa  42  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.04 
 
 
191 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  33.73 
 
 
200 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.7 
 
 
219 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1436  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  29.63 
 
 
222 aa  41.6  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.878923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.19 
 
 
219 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.19 
 
 
219 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.19 
 
 
219 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.94 
 
 
196 aa  41.6  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  31.3 
 
 
168 aa  41.2  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  31.76 
 
 
253 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  31.76 
 
 
253 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>