196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2766 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  100 
 
 
429 aa  847    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
423 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
428 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
420 aa  142  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 
440 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  23.53 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  23.04 
 
 
393 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
398 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  25.33 
 
 
397 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  24.68 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  30.19 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  31.76 
 
 
414 aa  77  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  29.1 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  32.7 
 
 
440 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  26.8 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  27.95 
 
 
411 aa  65.1  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
394 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  31.54 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  33.07 
 
 
421 aa  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  26.6 
 
 
422 aa  63.9  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  26.98 
 
 
403 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 
390 aa  61.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 
417 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  28.86 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  32.17 
 
 
403 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
516 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  35.34 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 
419 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  29.41 
 
 
417 aa  57  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  26.19 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  26.46 
 
 
383 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  25.86 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
410 aa  53.9  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  31.37 
 
 
407 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 
449 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.68 
 
 
439 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 
396 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 
511 aa  53.1  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
545 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  24.65 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
477 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 
503 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.29 
 
 
504 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
485 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 
449 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  30.34 
 
 
430 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  25.35 
 
 
453 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  25.35 
 
 
453 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 
453 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  25.35 
 
 
453 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  24.4 
 
 
403 aa  50.8  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  25.35 
 
 
453 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  25.35 
 
 
453 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  24.4 
 
 
403 aa  51.2  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  25.35 
 
 
453 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  25.35 
 
 
453 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  24.41 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 
409 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 
513 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 
415 aa  50.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  29.66 
 
 
437 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.43 
 
 
508 aa  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  23.62 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  23.62 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  23.62 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  23.62 
 
 
403 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  21.72 
 
 
401 aa  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
391 aa  49.7  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  22.33 
 
 
389 aa  49.7  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 
488 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  24.21 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 
522 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  23.71 
 
 
446 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  24.21 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  26.19 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  24.21 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  23.62 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  23.62 
 
 
403 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2103  major facilitator transporter  23.19 
 
 
449 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.552492  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  24.6 
 
 
439 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  29.44 
 
 
403 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  31.51 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  30 
 
 
509 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  32.23 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  23.62 
 
 
403 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  24.76 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>