69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2719 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  261  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  87 
 
 		 306 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  86 
 
 		 306 aa  179  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  85.57 
 
 		 306 aa  173  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  79.79 
 
 		 303 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  71.43 
 
 		 303 aa  158  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  84.31 
 
 		 307 aa  156  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  76.6 
 
 		 304 aa  154  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  76.92 
 
 		 305 aa  150  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  73.63 
 
 		 305 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  73.63 
 
 		 305 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  73.63 
 
 		 305 aa  149  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  84.34 
 
 		 307 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  83.13 
 
 		 307 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  74.73 
 
 		 305 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  74.73 
 
 		 305 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  72.63 
 
 		 306 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  75.82 
 
 		 306 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  71.58 
 
 		 306 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  70.53 
 
 		 307 aa  148  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  73.63 
 
 		 307 aa  147  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  70.53 
 
 		 307 aa  147  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  69.47 
 
 		 306 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  61.76 
 
 		 313 aa  146  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  67.68 
 
 		 309 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  68.42 
 
 		 299 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  70.65 
 
 		 306 aa  135  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  70.65 
 
 		 306 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  69.23 
 
 		 305 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  68.48 
 
 		 307 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.29 
 
 		 320 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.29 
 
 		 320 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  73.26 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  72.41 
 
 		 314 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  60.22 
 
 		 303 aa  123  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  80.85 
 
 		 255 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  38.37 
 
 		 315 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  41.11 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  41.98 
 
 		 313 aa  67.8  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  40.91 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.13 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.25 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  33.65 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  38.37 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.71 
 
 		 322 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.71 
 
 		 315 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  35 
 
 		 291 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  38.82 
 
 		 320 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  36.71 
 
 		 342 aa  63.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  35.44 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  31.65 
 
 		 291 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  35.29 
 
 		 337 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  32.56 
 
 		 323 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  30.85 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  35.63 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  43.53 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.11 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  41.38 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  37.78 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  35.9 
 
 		 314 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.12 
 
 		 293 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.47 
 
 		 296 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  34.52 
 
 		 297 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  32.95 
 
 		 291 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  23.47 
 
 		 303 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.7 
 
 		 320 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  28.87 
 
 		 328 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.76 
 
 		 298 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  31.52 
 
 		 324 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>