More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2657 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  100 
 
 
429 aa  875    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1644  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  78.97 
 
 
429 aa  699    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  64.02 
 
 
429 aa  586  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  52.28 
 
 
444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  53.36 
 
 
445 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  52.61 
 
 
445 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1589  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  54.95 
 
 
450 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  52.44 
 
 
461 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2114  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  52.06 
 
 
437 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000193548  normal  0.124187 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0763  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  53.43 
 
 
448 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.795648 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1167  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  54.14 
 
 
444 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.446021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  54.06 
 
 
440 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0124  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  51.84 
 
 
439 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0531  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  50 
 
 
437 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0064  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  48.63 
 
 
438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  52.13 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0751  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  47.09 
 
 
447 aa  401  9.999999999999999e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0974  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  48.14 
 
 
439 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47690  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  46.3 
 
 
564 aa  327  3e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29493  predicted protein  43.94 
 
 
416 aa  324  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0438763 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51286  pyrophosphate-dependent phosphofructose kinase  47.11 
 
 
563 aa  317  4e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50424  phosphofructokinase  46.13 
 
 
515 aa  308  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37009  predicted protein  43.35 
 
 
433 aa  300  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00175166  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  34.55 
 
 
341 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  36.05 
 
 
341 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  35.38 
 
 
341 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  33.24 
 
 
345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  33.24 
 
 
346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1331  phosphofructokinase  27.15 
 
 
680 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  35.36 
 
 
342 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  33.91 
 
 
342 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  34.39 
 
 
346 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  33.91 
 
 
341 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  35.17 
 
 
341 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  32.87 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  33.43 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  34.88 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  33.62 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  34.48 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  34.49 
 
 
341 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  33.05 
 
 
348 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  32.56 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  34.1 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  32.13 
 
 
365 aa  137  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  34.1 
 
 
342 aa  136  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  32.37 
 
 
343 aa  136  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  32.75 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  32.18 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  32.75 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  32.85 
 
 
351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  33.99 
 
 
373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  34.4 
 
 
341 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  30.98 
 
 
360 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  33.52 
 
 
372 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  32.3 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  30.66 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  30.51 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  32.75 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  32.87 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  32.75 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  32.75 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  33.96 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  31.79 
 
 
343 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  32.95 
 
 
342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  31.21 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  33.16 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  32.36 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2513  6-phosphofructokinase  32.89 
 
 
385 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1542  6-phosphofructokinase  29.79 
 
 
398 aa  127  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2085  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  31.47 
 
 
394 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  32.03 
 
 
372 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1792  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.09 
 
 
394 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1871  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.09 
 
 
394 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.444059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  31.94 
 
 
341 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  30.89 
 
 
365 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  31.46 
 
 
370 aa  124  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  31.76 
 
 
345 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  29.18 
 
 
326 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  30.62 
 
 
366 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  33.53 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  32.51 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  28.41 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  30.92 
 
 
344 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  31.13 
 
 
363 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0911  6-phosphofructokinase  30.1 
 
 
407 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  32.58 
 
 
363 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  29.94 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  31.07 
 
 
319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  29.05 
 
 
360 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  29.05 
 
 
360 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  30.61 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  28.9 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  30.03 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1732  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.21 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770131  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  29.91 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  31.27 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  30.49 
 
 
363 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  30.92 
 
 
341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  29.86 
 
 
364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  31.51 
 
 
359 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>