More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2647 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4471  hypothetical protein  76.36 
 
 		 272 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0712  hypothetical protein  74.81 
 
 		 271 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0746  hypothetical protein  74.81 
 
 		 271 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2051  hypothetical protein  73.33 
 
 		 273 aa  407  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0750  hypothetical protein  73.31 
 
 		 272 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5508  hypothetical protein  70.22 
 
 		 283 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.980211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1377  hypothetical protein  70.7 
 
 		 274 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1170  protein of unknown function DUF344  71.21 
 
 		 278 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0866985 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3502  hypothetical protein  67.92 
 
 		 273 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2307  hypothetical protein  70.82 
 
 		 276 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.127828 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4193  hypothetical protein  66.43 
 
 		 278 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1707  hypothetical protein  67.16 
 
 		 272 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00527204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4120  protein of unknown function DUF344  64.13 
 
 		 277 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.794478  hitchhiker  0.00182923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4100  protein of unknown function DUF344  59.41 
 
 		 280 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4075  hypothetical protein  59.18 
 
 		 271 aa  330  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6914  protein of unknown function DUF344  60.85 
 
 		 280 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  59.85 
 
 		 280 aa  329  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  59.85 
 
 		 280 aa  329  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  64.63 
 
 		 288 aa  328  5.0000000000000004e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  60.32 
 
 		 270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1564  hypothetical protein  60.94 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0877  hypothetical protein  61.98 
 
 		 277 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  57.3 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  56.09 
 
 		 276 aa  314  8e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  59.68 
 
 		 285 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  54.1 
 
 		 281 aa  313  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  60.41 
 
 		 256 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  56.59 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4042  protein of unknown function DUF344  62.88 
 
 		 281 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  55.06 
 
 		 304 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  57.2 
 
 		 324 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  55.06 
 
 		 304 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  58.2 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  58.4 
 
 		 337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  59.67 
 
 		 359 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  57.37 
 
 		 324 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  57.09 
 
 		 302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  59.27 
 
 		 280 aa  302  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  56.13 
 
 		 310 aa  300  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  56.32 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  55.27 
 
 		 305 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  53.93 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  58.2 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  56.08 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  52.9 
 
 		 318 aa  295  4e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  56.97 
 
 		 301 aa  295  8e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  54.2 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  55.68 
 
 		 304 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  54.37 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  55.68 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  54.37 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  53.93 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  51.7 
 
 		 338 aa  292  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  54.28 
 
 		 300 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  52.81 
 
 		 322 aa  291  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  54.94 
 
 		 314 aa  292  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  54.62 
 
 		 269 aa  292  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  59.57 
 
 		 285 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  55.34 
 
 		 316 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  52.82 
 
 		 292 aa  290  1e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  55.34 
 
 		 316 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  55.34 
 
 		 316 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  56.13 
 
 		 308 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  53.53 
 
 		 316 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  56.13 
 
 		 308 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  56.13 
 
 		 308 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  54.94 
 
 		 316 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  56.85 
 
 		 304 aa  289  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  56.85 
 
 		 304 aa  289  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  54.05 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  55.73 
 
 		 308 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  56.13 
 
 		 513 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  57.14 
 
 		 316 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  54.55 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  55.25 
 
 		 310 aa  285  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  54.55 
 
 		 304 aa  284  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  51.6 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  55.34 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  53.88 
 
 		 307 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  53.36 
 
 		 308 aa  279  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  53.36 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  53.36 
 
 		 308 aa  278  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  54.96 
 
 		 305 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  58.19 
 
 		 300 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  57.78 
 
 		 310 aa  270  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  55.84 
 
 		 369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  53.53 
 
 		 303 aa  265  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  55.31 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  54.47 
 
 		 316 aa  262  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  53.65 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  51.6 
 
 		 326 aa  261  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  57.21 
 
 		 405 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  55.16 
 
 		 357 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  55.86 
 
 		 365 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  50.8 
 
 		 326 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  53.42 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  56.05 
 
 		 297 aa  258  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  52.26 
 
 		 331 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  53.53 
 
 		 296 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>