288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2621 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
117 aa  235  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2223  transcriptional regulator, MerR family  55.56 
 
 
112 aa  123  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000299442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1997  transcriptional regulator, MerR family  54.7 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  51.28 
 
 
116 aa  120  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  55.34 
 
 
117 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
116 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  44.44 
 
 
116 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  55.13 
 
 
122 aa  99.4  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  51.9 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  51.32 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  51.95 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  51.32 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  50 
 
 
118 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  49.35 
 
 
118 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  40.52 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  51.32 
 
 
118 aa  87  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  48 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  48.05 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  46.84 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  47.37 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  46.84 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  37.27 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  45.12 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  45.45 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  46.75 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  44.87 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0051  transcriptional regulator, MerR family  39.25 
 
 
113 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1259  transcriptional regulator, MerR family  56.25 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  45.95 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  45.95 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  46.05 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2633  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  45.95 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  36.28 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0444  transcriptional regulator, MerR family  46.43 
 
 
208 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
137 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
137 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
137 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
137 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  44.59 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2236  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2607  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0978  transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 
110 aa  72  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0291  hypothetical protein  40.62 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2991  transcriptional regulator, MerR family  47.44 
 
 
108 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.950452  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  41.33 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0058  hypothetical protein  42.86 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0887  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0416797  hitchhiker  0.00000266118 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0580  hypothetical protein  38.74 
 
 
109 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1892  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2364  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1445  transcriptional regulator  39.13 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.236755  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1052  transcriptional regulator, putative  34.55 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.019007 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0108  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1521  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0401274  normal  0.779885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2379  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3851  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2536  regulatory protein MerR  37.5 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>