242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2592 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  100 
 
 
219 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  44.08 
 
 
215 aa  191  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  46.46 
 
 
199 aa  191  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  43.93 
 
 
216 aa  178  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  41.48 
 
 
1523 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  42.29 
 
 
1523 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  40.72 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  39.23 
 
 
1162 aa  132  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  38.15 
 
 
229 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  43.11 
 
 
1340 aa  125  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  37.06 
 
 
229 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  37.65 
 
 
229 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  39.16 
 
 
228 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  37.22 
 
 
229 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  46.71 
 
 
229 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 
457 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  36.47 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  35.88 
 
 
229 aa  118  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  35.88 
 
 
229 aa  117  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  35.88 
 
 
229 aa  117  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  35.88 
 
 
229 aa  117  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  35.88 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0639  Methyltransferase type 12  36.87 
 
 
222 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0661  Methyltransferase type 12  36.24 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.259712  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  32.56 
 
 
681 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  33.51 
 
 
231 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
581 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  34.01 
 
 
785 aa  101  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  30.58 
 
 
217 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 
996 aa  93.2  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  32.53 
 
 
247 aa  90.9  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  27.47 
 
 
249 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
1287 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  32.05 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1126  Methyltransferase type 11  36.55 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
274 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  33.77 
 
 
746 aa  79.3  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
1314 aa  79  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
1312 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
543 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
1256 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  25.37 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
335 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  29.14 
 
 
332 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.53 
 
 
353 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
353 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1426  methionine biosynthesis protein MetW  28.46 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
317 aa  61.6  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  26.88 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  27.54 
 
 
310 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  29.24 
 
 
326 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  30.99 
 
 
346 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3033  methyltransferase type 11  25.78 
 
 
504 aa  58.2  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 
326 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  30.67 
 
 
308 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3267  methionine biosynthesis MetW  28.89 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.05 
 
 
247 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.03 
 
 
272 aa  56.2  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
266 aa  55.5  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  27.92 
 
 
396 aa  55.5  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  26.52 
 
 
310 aa  55.1  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  27.34 
 
 
242 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  29.37 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.49 
 
 
247 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  25.41 
 
 
323 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.05 
 
 
247 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
310 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  32.26 
 
 
457 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  25.13 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.92 
 
 
672 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  28.85 
 
 
391 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  23.65 
 
 
285 aa  52.4  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  32.62 
 
 
308 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.48 
 
 
303 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  22.86 
 
 
262 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  27.22 
 
 
275 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  25.64 
 
 
303 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  25.61 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.97 
 
 
310 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  29.03 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  24.87 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  26.49 
 
 
305 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.25 
 
 
279 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  25.78 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3809  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
354 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  25.81 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  25.78 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  26.38 
 
 
303 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
306 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  32.71 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  26.67 
 
 
297 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  26.23 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3583  hypothetical protein  26.32 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134233  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  25.73 
 
 
298 aa  48.9  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.14 
 
 
254 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  29.06 
 
 
266 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.96 
 
 
234 aa  48.9  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3274  hypothetical protein  25 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>