More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2588 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
426 aa  887  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  31.62 
 
 
401 aa  181  3e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
426 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
409 aa  176  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
403 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
403 aa  164  2e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
415 aa  160  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
404 aa  153  6e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
445 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  29.31 
 
 
401 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
403 aa  150  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
414 aa  148  2e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
405 aa  146  8e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  31.21 
 
 
384 aa  143  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
415 aa  142  1e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
394 aa  142  2e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
392 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
410 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
391 aa  133  7e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
404 aa  131  2e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
401 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
391 aa  118  2e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
390 aa  115  2e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  28.21 
 
 
425 aa  115  2e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
393 aa  115  2e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
392 aa  114  4e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
425 aa  113  7e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
435 aa  111  2e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.72843e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
398 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  23.06 
 
 
778 aa  105  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
402 aa  104  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  1.45174e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
405 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
424 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
356 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
387 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
452 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 
812 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 
414 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
440 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  27.3 
 
 
403 aa  89.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
403 aa  89.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
409 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
440 aa  87.4  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
819 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
428 aa  87  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
550 aa  86.3  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  24.94 
 
 
413 aa  86.3  1e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
539 aa  86.3  1e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
419 aa  85.1  2e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  36.97 
 
 
353 aa  85.1  2e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
373 aa  84  5e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  29.78 
 
 
384 aa  83.6  6e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
401 aa  83.6  6e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
421 aa  82.4  1e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
445 aa  82  2e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
418 aa  81.6  2e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
392 aa  81.3  3e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
441 aa  80.5  5e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
397 aa  79.7  9e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
423 aa  79  2e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
424 aa  79  2e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
423 aa  77.8  3e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
403 aa  77.8  3e-13  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
810 aa  77.4  4e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
373 aa  77.8  4e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
447 aa  77.8  4e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
391 aa  77  6e-13  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  29.58 
 
 
803 aa  77  6e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
772 aa  76.6  8e-13  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
375 aa  76.3  9e-13  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
392 aa  75.9  1e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
346 aa  75.1  2e-12  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
379 aa  75.5  2e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
436 aa  75.5  2e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
384 aa  75.1  2e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.38 
 
 
381 aa  75.1  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
398 aa  75.1  3e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 
782 aa  74.7  3e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  31.15 
 
 
388 aa  74.3  4e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3932  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  28.87 
 
 
381 aa  74.3  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  28.87 
 
 
381 aa  74.3  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3913  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  28.87 
 
 
381 aa  73.9  5e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
407 aa  73.9  5e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.26 
 
 
412 aa  73.9  5e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
422 aa  73.9  5e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 
410 aa  73.9  6e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
422 aa  73.6  7e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
372 aa  73.2  8e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4039  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.55 
 
 
381 aa  73.2  9e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
404 aa  73.2  9e-12  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
396 aa  73.2  9e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.24 
 
 
462 aa  73.2  9e-12  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.24 
 
 
459 aa  73.2  1e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
363 aa  72.4  1e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.94 
 
 
443 aa  72.4  1e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
385 aa  72.8  1e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.94 
 
 
495 aa  72.8  1e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>