More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2538 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 252 aa  513  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  59.36 
 
 		 247 aa  289  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  35.61 
 
 		 377 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  35.6 
 
 		 363 aa  121  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.5 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  31.09 
 
 		 432 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  31.22 
 
 		 454 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  31.72 
 
 		 406 aa  88.6  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  30.15 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  26.69 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  31.72 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  40.21 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  33.06 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  35.24 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  31.97 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  28.4 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  26.2 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  32.69 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  32.79 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  33.03 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  24.11 
 
 		 471 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 123 aa  67  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  24.77 
 
 		 526 aa  65.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  24.73 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  25.42 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  31.03 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  25.24 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  32.17 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  28.24 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  29.17 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  23.79 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  27.38 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 		 459 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  35.53 
 
 		 271 aa  62  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 		 170 aa  62  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  34.04 
 
 		 124 aa  62  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  31.58 
 
 		 138 aa  62  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  34.04 
 
 		 124 aa  62  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  29.03 
 
 		 144 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3004  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  45.16 
 
 		 560 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2756  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  45.16 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394023  normal  0.393296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1421  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.16 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  23.7 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000099  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.85 
 
 		 567 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  45.16 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0058857  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 108 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  27.78 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  36.47 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3005  Rhodanese domain-containing protein  27.68 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.603948  normal  0.106826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  22.51 
 
 		 529 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  25.83 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.81 
 
 		 817 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  42.03 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.43 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  27.38 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  27.38 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  24.87 
 
 		 527 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  39.71 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  27.53 
 
 		 463 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  25.66 
 
 		 472 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  42.17 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  38.03 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.26 
 
 		 550 aa  58.9  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  32.38 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  32.85 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  23.87 
 
 		 549 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  23.87 
 
 		 549 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 		 114 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  22.81 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.36 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  38.03 
 
 		 567 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  30.69 
 
 		 170 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 		 116 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 153 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0729  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.14 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000675699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  31.82 
 
 		 113 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 103 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  30.48 
 
 		 127 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>