More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2486 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
198 aa  408  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.27479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  71.5 
 
 
202 aa  308  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  77.84 
 
 
203 aa  301  3e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  5.18233e-15  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  76.7 
 
 
204 aa  297  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  71.88 
 
 
204 aa  295  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  64.95 
 
 
206 aa  278  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  67.58 
 
 
212 aa  257  8e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  55.32 
 
 
189 aa  214  6e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  42.5 
 
 
188 aa  171  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  47.67 
 
 
211 aa  166  3e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  43.92 
 
 
218 aa  155  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  41.79 
 
 
208 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  47.37 
 
 
202 aa  147  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 
200 aa  146  2e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  46.63 
 
 
216 aa  145  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  44.51 
 
 
304 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  46.63 
 
 
221 aa  145  4e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  42.19 
 
 
195 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.09 
 
 
217 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  47.67 
 
 
242 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  41.34 
 
 
204 aa  141  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  40.72 
 
 
199 aa  140  1e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  55.74 
 
 
191 aa  140  1e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.29 
 
 
239 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  45.24 
 
 
237 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 
209 aa  138  4e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  43.02 
 
 
239 aa  138  5e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  43.02 
 
 
239 aa  138  5e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  43.02 
 
 
239 aa  138  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  41.71 
 
 
251 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  41.71 
 
 
251 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  53.23 
 
 
217 aa  138  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  41.34 
 
 
297 aa  138  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  41.71 
 
 
251 aa  137  8e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  41.34 
 
 
297 aa  137  9e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  52.71 
 
 
235 aa  137  9e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  41.71 
 
 
247 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  41.4 
 
 
285 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  50.38 
 
 
244 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  50.37 
 
 
206 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  38.24 
 
 
260 aa  135  3e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  52.5 
 
 
328 aa  135  3e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 
209 aa  135  3e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  43.88 
 
 
212 aa  135  3e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 
305 aa  135  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 
299 aa  135  6e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.04 
 
 
226 aa  134  7e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.1 
 
 
214 aa  133  2e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  52.99 
 
 
207 aa  133  2e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  43.01 
 
 
209 aa  133  2e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  35.92 
 
 
273 aa  132  2e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  43.01 
 
 
209 aa  133  2e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  39.11 
 
 
249 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  55.56 
 
 
261 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  37.16 
 
 
292 aa  131  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  49.15 
 
 
233 aa  131  7e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  37.16 
 
 
300 aa  131  7e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  54.24 
 
 
196 aa  131  8e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  39.02 
 
 
280 aa  131  8e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  39.58 
 
 
230 aa  130  1e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  52.5 
 
 
228 aa  130  1e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  38.39 
 
 
296 aa  130  2e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  51.69 
 
 
280 aa  129  2e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.67564e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  38.84 
 
 
296 aa  129  4e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  38.92 
 
 
201 aa  128  5e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  54.62 
 
 
208 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
245 aa  127  8e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  45.16 
 
 
174 aa  127  8e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  41.57 
 
 
243 aa  127  9e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  49.6 
 
 
216 aa  127  1e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  51.61 
 
 
283 aa  127  1e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6408  lytic transglycosylase catalytic  44.6 
 
 
253 aa  126  2e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  50.37 
 
 
146 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  45.32 
 
 
263 aa  125  4e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  50.4 
 
 
281 aa  125  4e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.00876e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  56.03 
 
 
222 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  39.89 
 
 
197 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  38.86 
 
 
329 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  50.86 
 
 
442 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  38.54 
 
 
281 aa  122  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  60.58 
 
 
296 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  60.58 
 
 
296 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  53.91 
 
 
215 aa  121  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  45.16 
 
 
261 aa  120  1e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  45.16 
 
 
261 aa  120  1e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  52.54 
 
 
217 aa  120  1e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  59.62 
 
 
293 aa  120  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  45.16 
 
 
261 aa  120  1e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.33422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  45.16 
 
 
261 aa  120  1e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  45.97 
 
 
261 aa  119  2e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.81259e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  45.16 
 
 
259 aa  119  2e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  5.72163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  39.78 
 
 
197 aa  119  2e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  48.51 
 
 
362 aa  120  2e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  45.97 
 
 
261 aa  119  2e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.65036e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  52 
 
 
278 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  57.84 
 
 
199 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  52.17 
 
 
291 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  45.16 
 
 
261 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  45.16 
 
 
261 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  46.32 
 
 
251 aa  119  4e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>