More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2482 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  100 
 
 
138 aa  283  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  77.34 
 
 
154 aa  217  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  71.2 
 
 
141 aa  197  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  62.12 
 
 
133 aa  167  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  60.16 
 
 
136 aa  166  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  61.79 
 
 
139 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  58.54 
 
 
147 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  49.59 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
141 aa  127  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  44.44 
 
 
132 aa  115  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  41.41 
 
 
137 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
128 aa  110  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
139 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 
138 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  41.32 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  40.16 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  41.41 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  40.16 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  38.89 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  38.89 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.8 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.8 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.8 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  37.4 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.72 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  38.66 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  39.37 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  39.06 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  39.06 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  38.89 
 
 
136 aa  88.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  37.29 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  42.24 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  38.46 
 
 
129 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  37.1 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 
135 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  40.17 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  35.94 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.29 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  36.21 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.77 
 
 
140 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
151 aa  83.6  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 
138 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  39.39 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  40.52 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  40.52 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  41.59 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
129 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  38.98 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  36.22 
 
 
129 aa  82  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
129 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.6 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  41.82 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  41.82 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  39.66 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  34.65 
 
 
136 aa  77  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  35.71 
 
 
320 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  33.87 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  36 
 
 
318 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  37.61 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>